关联分析在QTL定位中的应用.pdfVIP

山西农业科学2010，38(2)：12—14 JournalofShanxiAgriculturalSciences doi：10．39696．issn．1002—2481．201O．02．03 关联分析在 QTL定位中的应用 苗丽丽，刘秀林，温义昌 (山西农业大学研究生院，山西太谷 030801) 摘 要：玉米的许多重要农艺和经济性状都是复杂多基因控制的数量性状。随着分子标记技术的发展，利用 分子标记可以将数量性状位点(QTL)定位到染色体上。近年来出现的基于连锁不平衡 (LD)原理的关联分析 被广泛应用于玉米数量性状位点的定位上。介绍了关联分析的基本原理以及影响定位精度的主要因素。 关键词：玉米；耐旱性；数量性状位点(QTL)；连锁不平衡 (LD) 中图分类号 ：Q348 文献标识码 ：A 文章编号 ：1o02—2481(201O)02—0012—03 ApplicationofAssociationAnalysisinQTLMapping MIA0Li～1i．LIU Xiu-lin，WEN Yi—chang (SchoolofPostgraduatesShanxiArgiculturalUniversity，Taigu030801，China) Abstract：Manyimportanttraitsofmaizearecontrolledbyaseriesofgenes．Withthedevelopmentofthemaker，thepreei- sionofmappingQTLisgreatlyimproved．LinkagedisequilibriumarenowusedinplanttomappingQTL．Inthispaperwewillin- trodueetheprincipleofLD，andintroducethefactorsthateffectmappingprecisionofQTL． Keywords：Maize(ZeamaysL)；Droughttolerance；Quantitytraitlocus(QTL)；Linkagedisequilibrium(LD) 随着分子标记技术的发展，借助分子标记技 有效补充同。 目前，基于连锁不平衡(LD)的关联 术可以将控制重要农艺性状的基因 ／QTL定位在 定位的方法已经广泛运用于遗传研究中。随着植 染色体上。通过找到与耐旱性紧密连锁的分子标 物基因组学的迅猛发展，新的基因发掘方法不断 记 ，可实现分子标记辅助选择(Marker—assisted 涌现。基于连锁不平衡的关联定位已被证明是基 selection，MAS)，大大加速了育种进程。到 目前为 因发掘的有效手段。 止，已经定位了大量的与耐旱相关的QTL，但置 1 连锁不平衡的测定方法 信区间一般为 10cM。研究表明，15cM的范围内 可能包含有 400个基因。在如此大的范围内，无 LD是生物群体在 自然选择过程中出现的一 法鉴别 目标性状的表达是 由单个基因还是多个 种现象，早在 20世纪初期，Jinnings就提出了连 基因共同作用的结果。要实现 QTL的图位克隆， 锁不平衡 (LinkageDisequilibrium，LD)这一概念。 不仅要求 目标基因正确定位，而且要精细到 目前 所谓连锁不平衡，是指某一染色体上相邻的2对 分子克隆技术可以操作的程度l1l。因此，探讨精细 等位基因，如果2对等位基因同时存在的概率与 定位的原理及影响精细定位的因素不仅具有理 预期的概率出现显著差别，则称这 2个基因座位 论意义，而且也是实现定位和克隆的依据和前提。 存在连锁不平衡 。 近代分子遗传学研究发现，在某些情况下，