不同产地菊苣的ITS序列分析及模式识别研究.pdfVIP

中草药 Chinese Traditional and Herbal Drugs 第 43 卷 第 13 期 2013 年 7 月 ·1823 · 不同产地菊苣的 ITS 序列分析及模式识别研究 1 1* 2 1 1 1 1 周 俊 ，张 冰 ，吴丽丽 ，林志健 ，朱文静 ，孙博喻 ，王红坡 1. 北京中医药大学中药学院，北京 100102 2. 赣州市人民医院 药剂科，江西 赣州 341000 摘 要：目的 通过分析不同产地菊苣 Cichorium intybus 和毛菊苣 C. glandulosum 核糖体基因内部转录间隔区（ribosomal DNA internal transcribed spacer ，rDNA-ITS ）序列，为菊苣药材鉴定和品种鉴别提供DNA 分子标记。方法 采用广谱植物基 因组DNA 快速提取试剂盒提取 14 个产地的菊苣和毛菊苣样本的总 DNA ，利用ITS 序列扩增通用引物 PCR 扩增 rDNA-ITS 序列并测序。运用 DNAMAN V6 软件比较两品种菊苣样品 ITS 序列的差异。所有样品 ITS 序列上的差异碱基经数学处理后 使用 SPSS 17.0 软件对其进行聚类分析。结果 菊苣 ITS 序列种内相似度基本上在 99.2% 以上，毛菊苣ITS 序列种内相似度 在 99.8% 以上，而两品种间ITS 序列相似度在 99.2% 以下。两品种菊苣的ITS 序列上分别有多个特异性信息位点。聚类分析 实现了两品种菊苣 ITS 序列差异的识别。结论 rDNA-ITS 序列是菊苣和毛菊苣药材鉴定和品种鉴别的有效分子标记。 关键词：菊苣；毛菊苣；ITS 序列；鉴定；聚类分析 中图分类号：R282.12 文献标志码：A 文章编号：0253 - 2670(2013)13 - 1823 - 04 DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2013.13.023 ITS sequence analysis and gene pattern recognition of Cichorium intybus from different habitats 1 1 2 1 1 1 1 ZHOU Jun , ZHANG Bing , WU Li-li , LIN Zhi-jian , ZHU Wen-jing , SUN Bo-yu , WANG Hong-po 1. College of Pharmacology, Beijing University of Traditional Chinese Medicine, Beijing 100102, China 2. Department of Pharmacy, The People’s Hospital of Ganzhou, Ganzhou 341000, China Abstract: Objective To analyze the ribosomal DNA internal transcribed spacer (rDNA-ITS) sequence of Cichorium intybus and C. glandulosum from different habitats, and to provide DNA molecular marker for the identification of chicory. Methods The total DNA was extracted from the samples of C. intybus and C. glandulosum from 14 habitats by rapid broad spectrum of plant genomic DNA extraction kit. The ITS sequence was amplified by PCR with universal primer of ITS and then sequenced. The two kinds of IT