非专业研究生生物信息学课程教学探讨.pdfVIP

2010 NO．13 Chlna Education Innovation Herald 科 教 研 究 非专业研究生生物信息学课程教学探讨① 王鹏程 杜艳艳 (河南大学生命科学学院 河南开封 475004) 摘 要：生物信息学作 为新兴的交叉学科，已经成为生物学研究的强有力的辅助工具之一。本文针对 目前非专业研究生生转学信息 荦教学实或中的一些问题，提出在教学目的．教学内容．教学方法方面的思考，希望能够有助于推动非专业研究生生物信息学课程麓 学 的开展 。 关键词 ：生物信息学 教学内容 教学方法 中图分类号：G64 文献标识码 ：A 文章编号：1673—9795(2O10)05(a)一0056一ol Abstract：Bioinformatics has embodied largely enchargementon biologicalstudies．In this article，we discussed thepurpose and means ofbioinformaticscoursefornon--majorpostgraduate students，and hope providing valuable information to improvethequality of bioinformatics course． Key Wrods：BioinformaticsIPurpose of teaching；Means of teaching；Postgraduate 生物信息学是2O世纪末期才发展起来 BioinformaticsBasics”，提出了 “不要期望成 因的功能、进化、结构等各种信息，考察学 的一门新兴的交叉学科 ，其本质是利用计 为一个生物信息学专家”，强调通过应该生 生对各种生物信息学工具和软件的综合应 算工具和方法对生物学数据进行获取、贮 物信息学工其辅助实验室的研究工作， 用能力 ，以及分析问题、解决问题的生物信 存、组织和分析 l【】。近年来生物信息学迅速 “Half day on the web，savesyou half 息学的思维方式川。 发展 ，已经成为生物学研究的强有力的辅 month inthelab”(http：／／abc．cbi．pku． 助工具之一。从2002年开始 ，国内一些高校 edu．cn／)，在这方面做 出了卓有成效的探 3关注学科前沿，注意知识更新 开始开设生物信息学本科专业 ，逐步建立 索 。 作 为一门新兴 的学科 ，生物信 息学的 起生物信息学的本科培养体系 】。同时许多 需要注意 的是 ，一些基础生物信 息学 发展非常迅速 ，新的理论、算法和应用程序 高校的生物学 、医学以及农学专业和相关 的原理与背景知识对于理解和正确应用生 不断涌现。在研究生生物信息学教学中，应 的科研机构也针对非专业研究生开设相关 物信息学工具必需的，~IJBLAST参数的正 该不拘泥于现有的生物信息学教材 ，及时 的生物信息学课程 ，但 目前非专业研究生 确选择的基础需要基于对PAM和BLOSUM 纳入最新的研究成果 ，将相关研究领域 的 生物学信息学教学仍处于起步阶段。本文 打分矩阵的理解 】。在课程教学中也应该注 一 些新 的研究方法、网络资源以及工具软 就教学实践中的一些 问题做初步的思考 ， 重这些基础知识和基本理论的讲授 ，增强 件介绍给研究生。例如，在讲授多序列比对 希望能够有助于推动非专业研究生生物信 研究生对生物信息学基本原理的理解 ，促 时 ，不仅要介绍经典的ClustalW，同时也介 息学课程教学的开展。 进生物信息学思维方法的形成 ，培养灵活 绍MUSCLE等一些新的算法和研究工具I。 运用生物信息学相关工具的能力。