蛋白质化学答案.docVIP

第一章? 绪?? 论1．蛋白质组：一个基因组内所有基因表达的全部蛋白质。定义有什么不足。??? 一个有机体在不同发育阶段，不同组织和器官，其基因组是都是一样的，即基因组是一个相对静态的概念。作为基因表达产物的蛋白质，其种类和数量在不同的时间，组织及环境下是不同的，即蛋白质组是一个动态的概念。蛋白质组的定义没有反映其时间性和空间性。基因组不论大小，其核苷酸的数量总是很明确的。然而，饰，如磷酸化、糖基化对蛋白质组来说，大部分蛋白质在合成后都进行化学修、酰基化等，这样蛋白质组的蛋白质种类将是基因组基因数目的几倍。蛋白质组的定义没有反映出蛋白质复杂的化学修饰和与基因数量的不对等性。2．如何理解从基因组－蛋白质组是一个复杂而漫长的里程。??? 基因组研究可以通过序列预测潜在的基因，从而进行研究。但遗传信息从DNA传递到蛋白质的过程中，存在着RNA水平和蛋白质水平上遗传信息的加工，使得许多蛋白质很难找到直接对应的ORF，为研究带来困难。基因组不论大小，其核苷酸的数量总是很明确的。然而，对蛋白质组来说，大部分蛋白质在合成后都进行化学修饰，如磷酸化、糖基化、酰基化等，这样蛋白质组的蛋白质种类将是基因组基因数目的几倍。??? 在个体发育的不同阶段或细胞的不同活动时期，细胞内产生的蛋白质种类是不一样的，而且不同蛋白质的寿命不同。蛋白质的另一个特征是，不同的蛋白质通常分布在细胞的不同部位，它们的功能与其空间定位密切相关。更为重要的是，许多蛋白质在细胞里不是静止不动的，它们在细胞里常常通过在不同亚细胞环境里的运动发挥作用。??? 不同蛋白质的相互作用导致了不同的功能，或参与信号转导，或形成蛋白质复合体，成为细胞结构或参与调节转录。使得我们无法从基因组水平对蛋白质演绎的复杂生命活动加以描述和预测。??? DNA链上只有四种碱基排列，蛋白质有20氨基酸组合（不算氨基酸修饰）。溶解度、稳定性等性质各异。细胞内蛋白质含量差异，蛋白质之间达106数量级，存在蛋白质类型的干扰。使得对蛋白质研究较为困难。虽然蛋白质组学研究的支撑技术（双向凝胶电泳、质谱技术、生物信息学技术等）已经取得了巨大的进步并在蛋白质组学研究中发挥着决定性的作用，但不可否认，低检测力、缺乏快速、高效的手段是当前蛋白质组学研究的瓶颈。??? 所以，从基因组－蛋白质组是一个复杂而漫长的里程。 第二章? 蛋白质组成及结构1．各种氨基酸的三字母符号和单字母符号??? 甘氨酸（Gly，G）?? 亮氨酸（Leu，L）??? 丙氨酸（Ala，A）?? 异亮氨酸（Ile，I）?? 缬氨酸（Val，V）?? 脯氨酸（Pro，P）??? 丝氨酸（Ser，S）???? 苏氨酸（Thr，T）??? 半胱氨酸（Cys，C）?? 甲硫氨酸（Met，M）??? 天冬氨酸（Asp，D）??? 谷氨酸（Glu，E）???? 天冬酰氨（Asn，N）?? 谷氨酰氨（Gln，Q）??? 赖氨酸（Lys，K）????? 精氨酸（Arg，R）????? 组氨酸（His，H）??? 苯丙氨酸（Phe，F）??? 酪氨酸? （Tyr，Y）??? 色氨酸（Trp，W）2．名词解释： ??? 同源蛋白质（homologous protein）：一组来自同一祖先，随着进化而分化为具有不同结构但功能相同的蛋白质。??? 趋异突变（divergent mutation）：来自于同一祖先的蛋白质，在进化过程中产生突变，导致蛋白质一级结构改变，使蛋白质被淘汰或形成新蛋白质。??? 趋同突变（convergent mutation）：进化过程中，同类蛋白质产生结构趋于类似的变异，导致产生类似的结构特征。??? 中性突变（neutral mutation）：在进化过程中产生突变，不影响蛋白质功能的突变。其变异限于性质相似的氨基酸。??? 保守替换（conservative substitution）：同源蛋白质的种属差异多见于蛋白质分子表面的氨基酸残基，替换常常发生在性质相似的氨基酸残基间，称作保守替换??? 蛋白质家族（protein family）：具有重要的一级结构相似性，或（和）显示出结构功能相似性的一组蛋白质。??? 蛋白质超家族（superfamily）：一级结构几乎没有相似性的两个或多家族有时也形成相同的主要折叠（fold），并具有功能上的相似性，这些家族属于超家族。??? 蛋白质亚家族（subfamily）：蛋白质家族中氨基酸序列差异小于20%者，可再划分为多个亚家族。??? 单位进化周期（unit evolution period）：蛋白质在进化过程中每一个残基的变异所需时间。??? 蛋白质构象：蛋白质的空间结构，即蛋白质肽链的所有碳原子由于单链旋转而稳定于一定的空间排布。??? 蛋白质