用ISSR分子标记鉴别黑木耳生产菌株的研究.pdfVIP

用ISSR分子标记鉴别黑木耳生产菌株的研究.pdf

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首届全国食用菌中青年专家学术交流会 用ISSR分子标记鉴别黑木耳生产菌株的研究 马庆芳,张介驰,张丕奇,戴肖东。孔祥辉,韩增华,壬玉文 (黑龙江省科学院应用微生物研究所,黑龙江省哈尔滨市,150010’ 个引物能对供试的z7个黑木耳菌株基因组DNA进行扩增,获得的指纹图谱清晰稳定、多态性强。用NTSYS软件进行聚类分 析,相似水平在0.75时,可将27个供试黑术耳菌株分为3个组群。研究结果说明ISSR分子标记,可以有效地用于黑术耳 生产菌株快速准确的鉴别,是黑术耳指纹图谱分析的理想手段。 关键词:ISSR:黑木耳生产菌株;分子鉴别;聚类分析 ISSR(inter simplesequence 点是:ISSR标记利用在物种基因组中经常出现的重复序列本身设计引物,无须预先克隆和测序,降低了开 发费用,并且引物可以在不同物种间通用”““;它以16~18核苷酸的重复序列为引物(3端有1~2个 选择性简并碱基)直接在基因组DNA中进行PCR扩增。1,扩增谱带稳定丰富。我所曾运用多种分子标记 鉴别黑木耳生产菌株,结果表明ISSR揭示的多态性较高,可获得几倍于RAPD的信息量,精确度可与RFLP 相媲美,并具有SSR的稳定性,是鉴别鉴定黑木耳菌株的非常理想的分子标记之一。 1材料与方法 1.1供试菌株 表1供试黑木耳生产菌株及来源 1.2菌丝培养及DNA提取 DNA。获得的菌丝体总DNA 0Dm一比值在1.30~1.65之间。 1.3ISSR反应 所用引物由上海生工(Sagon)合成。 1.4电泳检测 u 将ISSR反应产物与31溴酚蓝指示荆混合,用2.O%琼脂糖凝胶,0.5XTBE缓冲体系,5V/cⅢ电压电 泳,0.5ng/mlEB染色15min,以DL2000为Marker,凝胶成像扫描记录结果。 1.5数据统计分析 首届全国食用菌中青年专家学术交流会 根据PcR产物的电泳结果,在凝胶的某个相同的迁移率位置上有条带的记为l,无条带的记为0。用NTSYS 软件进行聚类分析,建立树状图谱。 2结果与分析 2.1ISSR方法鉴别黑木耳菌株指纹图谱 进行扩增,或扩增条带少,10个引物可对供试的27个黑木耳生产菌株进行扩增,从中选择了扩增重复性好、 带型清晰的4个引物作为本次试验的供试引物。这4个供试引物能对现有的27个黑术耳菌株基因组DNR 进行扩增,获得的指纹图谱多态性强,具有明显的菌株特异性。阴性对照无条带出现。 进行黑木耳DNA多态性分析,每次扩增片段多,多态性高(见图1~图3),可用于黑木耳菌株间的亲缘关 系分析研究。 图1 ISSR引钫B扩增图谱 图2 ISSR引物c扩增图谱 圈3 ISSR引物F扩增图谱 首届全国食用菌中青年专家学术交流会 2.2ISSR方法鉴别黑木耳菌株聚类分析 关系较近或者是同一菌株。在相似水平为O.75时可将供试的27个黑木耳生产菌株分为三个组群。第一组 D28共17个菌株;第二组群包括:D2、D20、D26、D29、D30、D3l、D32共7个菌株;第三组群:D9、 D13、D24共3个菌株。 圈5ISsR方法鉴别罴术耳菌株grsY$树状图谱 3讨论 本研究运用ISSR分子标记技术鉴别黑术耳生产菌株,筛选出的引物扩增多态性强,结果稳定。在相似 聚类分析结果与传统的表观分类和同工酶分类结果基本相同,第一组群为耳根小单片簇生、耳片厚、中晚 熟品种,这一组群中的黑木耳菌株栽培面积大,占东北地区黑木耳栽培总量的90%以上,菌株名称多,菌 株间差异不大,遗传基础较接近。第二组群为菊花大朵、耳片薄、早熟品种;第三组群为耳根大单片簇生、 耳片薄、中早熟品种,在东宁县和吉林省有部分菇农栽培,第二组群和第三组群占黑木耳栽培总量的份额 很小,说明ISSR方法用于黑木耳生产菌株的鉴别是可靠的。 I)Nh指纹技术的出现,给种质鉴定带来了革命性的变化,由于它直接反映DNA水平上的差异,具有高度 的专一性和特异性,不同物种

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