对硝基苯酚降解菌Pseudomonas sp.PDS-7的降解特性及其降解相关基因的克隆.pdfVIP

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微生物学报ActaMicrobiologicaSinica 48(11):1486-1492;4November2008 ISSN0001—6209;CNll-1995/Q http:/,1ournals.im.ac.cn 对硝基苯酚降解菌Pseudomonassp.PDS-7的降解特性及 其降解相关基因的克隆 董小军,洪青,李恋,李顺鹏 (南京农业大学生命科学学院,农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,南京 210095) 摘要:【目的】本研究的目的是分离对硝基苯酚(PNP)降解菌,研究其对 PNP的降解特性;克隆其降 解相关基因,并进行表达。【方法】本研究通过富集培养法和系列稀释平板涂布法分离 PNP降解菌 株;采用形态观察、生理生化特征测定和 16SrDNA分析对菌株进行初步鉴定;通过摇瓶试验研究 菌株降解特性;利用 SEFA.PCR技术克隆降解相关基因,并亚克隆到表达载体 pET29a中,构建重 组表达质粒pETpnpC,再转入受体菌E.coliBL21(DE3)hh进行诱导表达 ;通过分光光度法测定表达 产物的酶活力。【结果】分离到一株PNP降解菌PDS.7,将该菌株鉴定为假单胞菌属 (Pseudomonas sp.);该菌株能够以PNP作为唯一碳源、氮源和能源生长 ,菌株对 PNP的最高耐受浓度为80mg/L, 最适降解温度为 30。C,偏碱性条件有利于菌株对PNP的降解 ;克隆了PNP降解过程中的偏苯三酚 1,2双加氧酶基因pnpC及马来酰醋酸还原酶基因pnpD (GenBank登陆号 EU233791);将 pnpC在 E.coliBL21(DE3)菌株进行了诱导表达,表达产物对偏苯三酚和邻苯二酚均有邻位开环活性,比活 力分别为0.45U/mgprotein和 0.37U/mgprotein,表明偏苯三酚 1,2.双加氧酶基因pnpC得到了活 性表达。【结论】分离鉴定了一株 PNP降解菌Pseudomonassp.PDS一7,研究了该菌株的降解特性 , 克隆和表达了降解相关基因。 关键词:对硝基苯酚;Pseudornonassp.PDS.7;降解特性;基因克隆 中图分类号:X172 文献标识码 :A 文章编号 :0001—6209(2008)11.1486—07 对硝基苯酚 (PNP)是一种在环境中广泛分布的 属 (Moraxellasp.)及芽孢杆菌属 (Bacillussp.o这 硝基芳香族化合物 (NACs)uJ,它主要来源于有机 些菌株中存在的 PNP降解途径主要有两条 :对苯二 磷农药,如:对硫磷、甲基对硫磷的水解以及医药、炸 酚 (hydroquinone)途径和偏苯三酚 (hydroxyquino1) 药、农药、染料等生产企业的排放2【’。由于PNP对植 途径 (图1),前者在革兰氏阴性菌中较多5【,,而后者普 物、微生物、动物都有毒性,已被美国国家环保署列为 遍存在于革兰氏阳性菌 ,。但是,PNP降解基因克隆 优先控制污染物,限制其水体中浓度必须小于10ng/L4【】。 相关报道还较少。Bang等从Pseudomonassp.ENV2030 PNP的生物降解一直是环境科学研究领域关注课题之一。 中克隆了通过对苯二酚途径降解PNP的相关基因 J。关 近年来,国内外学者分离报道了多株 PNP降解 于通过偏苯三酚途径降解PNP及其相关的基因克隆方面 菌,主要分布在假单胞菌属 (Pseudomonassp.)、节 的报道共有3例 ,,加】,这些途径中的单加氧酶基因均属 杆菌属 (Arthrobactersp.)、红球菌属 (Rhodococcus 于二组分扩散性黄素蛋白单加氧酶 (two.component sp.)、伯克氏菌属 (Burkholdriasp.)、莫拉克斯氏菌 flavin—diffusiblemonooxygenase,TC.FDM )家族 。在 基金项目:国家 “863计划”(2007AA061101);科技部 自然科技资源平台项 目(2005DKA21201—2) 通讯作者。Tel:+86

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