基于小波变换_SAM方法的差异表达基因筛选研究.pdfVIP

第 27卷 　第 5期 北京生物医学工程 Vo l. 27　No. 5 2008年 　10月 B eij ing B iom edical Engineering O ctober　2008 基于小波变换 SAM 方法的差异表达基因筛选研究 伍亚舟 　张玲 　易东 　刘岭 摘 　要 　目的　基于微阵列表达数据 ,探索差异表达基因筛选的新的有效方法 。方法 　采用基于小波变换 Δ ( ) SAM 方法 ,通过调节 值 ,计算对应的假阳性率 FPR ,从而筛选差异表达基因。结果 　相对于小波变换前 ,基于 小波变换 SAM 方法获得更好的筛选效果 。结论 　本方法适用于微阵列表达数据 ,获得更好的差异表达基因筛选 效果 ,并且比传统的方法更具灵活性 。 关键词 　基因芯片 ;差异表达基因;小波变换 ; SAM 中图分类号 　R3 1804　　　文献标识码 　A 　　　　文章编号 　1002 - 3208 (2008) 05 - 0454 - 04 Iden tify in g d ifferen tia l expression gen es ba sedwavelet tran sform SAM m ethods　WU Yazhou, ZHAN G L ing, YI D ong, L IU L ing 　D ep a rtm en t of H ea lth S ta tis tics, M ilita ry P reven tive M ed icine Colleg e, Th ird M ilita ry M ed ica l Un iversity, Chong qing　400038 【A b stract 】　O bjective　To search a new and effective m ethod for screen ing differen tial exp ression genes ba sed on m icroarray exp re ssion data. M ethod s　B a sed wavelet tran sform SAM , differen tial exp re ssion gene s were screened through adju sting Δvalue and comp uting the corresponding false po sitive rate ( FPR ) . Results　The better re su lts of differen tial exp re ssion gene s were obtained w ith wavelet tran sform (W T) SAM m ethod s comp ared to nontran sform. Conclusion　The m ethod is su itab le to analyze m icroarray exp re ssion data and screen sign ificant genes. W hat ’s more, the m ethod is more flexib le than traditional m ethod s. 【Key words】　m icroarray; differen tial exp re ssion genes; W T; SAM 因 ,为进一步的实验和研究提供线索 。差异表达基 1　研究背景