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土壤氮素转化的关键微生物过程
贺纪正
中国科学院生态环境研究中心,北京100085
摘要:氮的生物地球化学循环主要由微生物驱动,包括固氮、硝化、反硝化
和氨化作用。氨氧化作用是硝化作用的第一个反应步骤,也是限速步骤,是调控
硝化过程的关键环节。长期以来,氨氧化过程被认为是由变形菌纲中一小部分细
菌类群 (氨氧化细菌)所进行的化能自养过程,但在多数酸性土壤中检测不到氨氧化
细菌,或发现氨氧化细菌的存在与硝化作用关系不大,酸性土壤硝化作用的机理
一直不够清楚。我们2007年首次报道了酸性土壤中存在大量氨氧化古菌,且氨氧
化古菌的数量与土壤硝化潜势呈显著正相关关系,预示着氨氧化古菌对酸性土壤
氨氧化有重要贡献(Heetal.,2007)。
不同自然生态系统中氮循环的新环节
胡宝兰沈李东刘帅蔡 琛何崭飞 耿 莎徐向阳 郑平*
浙江大学环境与资源学院,310058
摘要:厌氧氨氧化(anaerobicammoniumoxidation,anammox)是以氨为电子
供体,以亚硝酸为电子受体的生物反应,是新发现的全球氮循环的关键环节。而
最近发现的甲烷型反硝化(Nitrite-dependentanaerobicmethaneoxidation,n-damo)
是以甲烷作为电子供体还原硝酸盐或亚硝酸盐的新型生物反应,该反应的发现是
对全球氮循环的一个补充,也是氮循环的一个新环节。
第十五次全国环境微生物学术研讨会
人工脱氮系统,已发现的8种anammox菌中有7种来自于人工系统。但越来越多
的证据表明,anammox菌广泛分布于自然生态系统中,如厌氧海洋沉积物和水体、
淡水沉积物和水体、陆地生态系统以及一些特殊的生态系统如油田生境等。
Anammox反应在海洋生态系统中起到了非常重要的作用,已有的研究已证实
anammox反应对海洋氮循环的贡献率高达50%以上,但有关其在淡水生态系统和
陆地生态系统中的分布及贡献则报道得不多。最近有一些研究者报道anammox反
应对内陆湖泊氮循环的贡献率为9%.40%,对农田土壤氮循环的贡献率为4%.37%,
这些研究结果表明anammox反应在淡水生态系统和陆地生态系统中也起到了非常
重要的作用。在不同的生态系统中anammox菌的种群分布不同,它们对该系统中
氮循环的贡献率也不同,这主要是由该生态系统的主要环境因子如有机质含量、
基质浓度(N03-)和盐度等决定。
参与n.damo反应的微生物是归属于NCIO门的“Candidatus
Methylomirabilis
的发现偶联了自然界的碳氮循环,在自然生态系统中所起的作用巨大,另外由于
甲烷是地球大气中仅次于二氧化碳的第二号温室气体,它引起的温室效应是同等
质量二氧化碳的20—30倍,因此,n.damo作用对于减少甲烷的排放,降低温室效
应具有明显的效果。因此在自然生态系统中,n.damo作用必定是碳、氮循环都将
重点关注的内容。但到目前为止对于参与该反应的微生物在自然生态系统中的分
布报道得很少。发生n.damo反应的条件是甲烷和亚硝酸盐或硝酸盐的共存。在河
道、河口及近海生态系统中,由于大量污染物的排入,在厌氧层有机污染物的分
解会产生大量的甲烷,同时释放氨,氨在有氧的情况下会被氧化成亚硝酸盐和硝
酸盐,因此在缺氧层界面或以下会有甲烷和亚硝酸盐或硝酸盐共存的情况,因此
这些区域很可能会发生n.damo作用。
本课题组选择了钱塘江河流生态系统、椒江河口生态系统、和东海近岸生态
系统,采用常规测序及高能量测序手段、16SrRNA和功能基因克隆文库构建、实
循环关键环节的微生物菌群进行种群多样性、种群数量、种群分布及其主要环境
影响因子进行了研究。研究结果探明了钱塘江底泥中从上游到下游7个采样点、
菌的种群多样性、种群数量以及种群分步的情况,并通过RDA和PCA分析探明
了影响这两大类菌的种群多样性、种群数量和种群分布的主要环境影响因子。研
究结果对于阐明这三个不同生态系统中氮循环不同环节的组成以及不同环节的贡
献率具有重要的意义。
2l
不同自然生态系统
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