分子系统学研究中多源数据集的分析策略与方法.pdfVIP

分子系统学研究中多源数据 集的分析策略和方法 黄 原，刘 艳 (陕西师范大学生命科学学院，西安 710062) 摘 要：目前越来越多的分子系统学研究采用多基因序列。如何分析来源于多个相对独立的遗传系统的序列数 据或通过不同方法获得的数据集已成为分子系统学研究中面临的主要挑战之一。本文综述了目前流行的多源数 据集的分析策略和方法，包括数据的联合方法、有条件的数据联合方法、先验定义的数据划分方法、基因树简约 法、分类学相合性方法和相容证据分析方法。最后，对分析多源数据集过程中遇到的数据集之间的不相合和大数 据集分析问题进行了讨论并提出了可能的解决方法。 关键词：系统发育；多源数据集；总体证据法；联合方法 andmethodsfor datasets Strategy analyzing from SOUrcessources‘inmolecUlar multiple p’hyllogenet。i‘cs multiple Yan Yuan，Liu Huang ofLife Normal 7 (School Sciences，Shaanxi 10062) University，Xi’an，Shaanxi Abstract·The havebeenmoreand usedin more molecular inre— multiplegenesequences frequently phylogenetics in cent ofthe molecular ishowto thedatasetscome years．Onemanychallengingproblems phylogeneticsanalyze from or meansofdifferentmethods．Herewefirstreviewedthe andmethods multiplegeneticsystemsby strategies to combined combined adoptedanalyzingmultipledatasets，includingapproach，conditional fined tree data evidence．Then，wedis— partitionapproach，geneparsimony，taxonomiccongruence，andcompatible cussedthetwomain encounter datasets problemsusually duringanalyzingmultipledatasets，incongruenceamong and dataset the