振动探针用于天冬氨酸二肽结构特性研究.pdfVIP

振动探针用于天冬氨酸二肽结构特性研究 蔡开聪 刘的文 陈艳芳 福建师范大学化学与化工学院，福建 福州 350007 摘要 借助量子化学从头算方法，在B3LYP/6-31+G(d)水平下开展气相中天冬氨酸二肽结构特性研究， 同时引入对分子结构敏感的振动探针酰胺-Ⅰ带，考察分子处于不同二级结构时的振动光谱参数。研究结果 表明，气相中天冬氨酸二肽倾向于形成C5和C7eq等稳定构型，且二肽分子处于不同构型时酰胺-Ⅰ带会发生 显著频移。通过势能分布分析方法对二肽分子中的酰胺-Ⅰ带进行了指认，并详细考察了酰胺-Ⅰ带振动频率 与分子二级结构之间存在的相关性，为借助光谱手段开展多肽二级结构检测鉴定提供了必要的理论依据。 关键词 振动光谱；酰胺-Ⅰ带；天冬氨酸二肽；二级结构；量子化学计算 VibrationalModeUsedasASecondaryStructuralProbeforAsparticAcid Dipeptide CAIKai-congLIUDi-wenCHENYan-fang CollegeofChemistryandChemicalEngineering,FujianNormalUniversity,Fuzhou 350007,China Abstract ThestructurefeatureofasparticaciddipeptidewasinvestigatedbyabinitiocalculationunderB3LYP/6-31+G(d)lev el.TheamideImode,whichwassensitivetothesecondarystructureofpolypeptides,wasintroducedasastructuralprobe.The resultsshowedthatasparticaciddipeptidetrendedtoformtheconformationlikeC5,C7eqandetc.,wherethevibrationalparame tersofamide Ⅰmodewerequitedifferent.ThetwoamideImodesofthedipeptideunderdifferentconformationwereassigned bythepotentialenergydistributionanalysis,andthecorrelationbetweenthesecondarystructureandthevibrationalfrequencyof amideImodewasthenrevealed,whichwouldbequiteusefulinthestructuredeterminationforpolypeptides. Keywords Vibrationalspectroscopy;Amide-Imode;Asparticaciddipeptide;Secondarystructure;Abinitiocalculation