藏羚羊细胞色素b基因序列分析与系统进化研究.pdfVIP

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竺竺!兰潮黼瀚霜露图鋈盔銎霉盈圆圆函墨蕊圈 李辉。吴登俊 (四川农业大学动物科技学院,四川雅安625014) 麒羊细艴素b基因序列分析和系一 摘要:本文分析了藏羚羊的细胞色素b基因的核苷酸序列和氨基酸序列与其他 终止密码组成。由非同义突变所引起的 9种动物的差异,结果显示藏羚羊的核苷酸序列有13个特异突变住点,这些突变位点 细胞色素b氨基酸变异情况见图2:其 有3个为非同义突变。用核苷酸和氨基酸两种序列分别计算遗传距离和构建NJ进化 中有3个氨基酸的变异是藏羚羊的氨基 树,结果都有差异。 酸序列独有的,分别是19、108、309位。 关键词:藏羚羊;细胞色素b;进化树; 2.3用核苷酸序列计算的序列差异和 双参数距离见表1,用氨基酸序列基于 藏羚羊是全球十大濒危物种之一, 2.1序列经联配,结果显示本文所采用 也是我国青藏高原的特产动物,经过漫 的细胞色素b基因的全序列长度全部为 2。 长的演替和发展,该物种在外部形态、内 1140bp,既没有插入位点,也没有缺失和2.4以牦牛的序列作为外群,用核苷酸 部器官结构,以及生理生化、生态习性和 不确定位点。藏羚羊细胞色素b基因的 行为上都表现出了与青藏高原独特自然 全序列T、c、A、G四种核苷酸的比例分 进化树见图3,用氨基酸序列基于 条件的适应性,它耐高寒、抗缺氧、食料 另0为26.6%、28.8%、31.6%、13.1%,碱基 要求简单,而且抗疾病,因此藏羚羊在科 4。 G相对缺乏,A+T含量明显大于G+C含 学研究、生态平衡等方面都具有难以估 量。10条序列共有变异位点382个(图3讨论 量的科学价值,具有不可替代的物种保 1),其中有12个变异位点是藏羚羊的细 从图2可以看出,有3个氨基酸的 护价值。线粒体DNA上的Cytb基因进胞色素b基因序列独有的,分别是55、 变异是藏羚羊独有的,分别是19、108、 化速度适中,在系统进化和分类研究中 192、323、348、369、546、783、822、900、 具有很好的适用性,它的序列被广泛的 926、957、1005、1077位的变异。 926位的核苷酸变异导致的,其他9个 应用于动物类群的系统发育和起源进化 2.2将细胞色素b基因的核苷酸翻译 变异位点为同义突变,没有导致氨基酸 研究中。对于藏羚羊的分子生物学方面 成氨基酸序列,由379个氨基酸和一个 的变化,这些氨基酸的变异是否引起其 的研究很少,所以,本文拟对藏羚羊的细 胞色素b基因的序列进行分析,以期为 表1 不同动物细胞色素b基因序列的双参数距离和序列差异 藏羚羊的系统发育、分类以及保护提供 牛 藏羚羊 臆羚 盘羊 北山羊 绵羊 岩羊 印度黑羚 羚牛 山羊 牛 O.172 0.166 0.167 n166 0.179 0.166 0.172 0.177 016l 分子生物学依据。 藏羚羊 0.172 0.125 O.107 0.129 0.!18 0.118 0.154 O.123 O.126 1材料与方法 臆羚 0.166 O.125 n125 0.13l O.134 0.125 0.174 0.130

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