Her2(+)-Her2(-)乳腺癌差异表达microRNAs的生物信息学分析.pdfVIP

山东医药2012年第52卷第33期 Her2(+)／Her2(一)乳腺癌差异表达 microRNAs的生物信息学分析 曾融，张积仁，姜茂竹。麦仲伦。吴钢，郑燕芳 (南方医科大学珠江医院肿瘤中心，广州510282) 摘要：目的通过文献挖掘与生物信息学分析的方法，探讨Her2(+)／Her2(一)乳腺癌之间差异表达的mi— press子数据库开展检索，使用关键词“breast microRNAs的靶向基因，取其合集进行富集分析，最后将富集得到的基因利用David数据库进行分析，从而得到了 靶向基因参与不同信号通路，实现多种生物学功能。 关键词：乳腺肿瘤；受体，Her2；小RNA病毒；计算机生物学 中图分类号：R737．9文献标志码：A 文章编号：1002-266X(2012)33-0005-03 between Bioinformatics—basedfor microRNAs analysisdifferentlyexpressed Her(+)／Her(一)breastcancers ZENG Ji—Fen，JIANGMao-zhu，MAIZhong—lun，形UGang，ZHENGYah-fang Rong，ZHANG SouthernMedical 510282，P．R．China) (ZhujiangHospitalof Univenity，Guangzhou To functionsand of miRNAsbetweendiffer- differentially Abstract：Objectiveexplorebiological pathways expressed entHer2 ofbreastcancer literature andbioinformatic outthe phenotypes through mining analysis．MethodsCarrying searchin sub-databaseoftheNCBIdatabaseand sub—databaseoftheEBI GEO，the ArrayExpress，the database，using determinetheuseful toliterature the words“breastcancer…‘miRNA”to by key literature．Accordingprovidedpmicroarray cancerdifferencebetweenthe ofmiRNAswas miRNAs data，Her2(+)／(一)breast expression found．Finally，using the miRNAs and out softwaresto all prediction predict differentiallyexpressed targetgenescarrypathwayanaly— targetgene sis．ResultsTwomicroRNAscollections inHer2 ofdifferentbreast U— di