毛白杨PtCesA5多态性和生长和木材品质性状的联合遗传学研究.pdfVIP

胞组成，我们利用所有差异基因的基因本体论(GO)注释，通过单富集分析(SEA), 共找到了 33 个重要条目，其中涉及分子功能的 5 个，生物过程的 24 个，细胞组 成的 4 个，可明显看出差异基因所涉及的生物过程十分广泛，主要集中在各类囊 泡中。考虑到细胞壁对于杨树的经济价值，我们对于探究与细胞壁相关的核基因 组光合基因很感兴趣。我们发现了一类仅上调表达的差异基因，木葡聚糖转葡糖 苷酶（XET ），它们对于细胞壁的重建和细胞扩展有重要作用，可能是细胞伸长 过程中的关键酶。为再一次确认筛选基因与光合作用相关，并探究其对于杨树木 材性状的关联，我们通过单核苷酸多态性（SNP ）技术分析了7 个候选基因共 124 个 SNP 分子标记与 4 个光合性状，7 个木材性状的相关性。共有 24 个 SNP 分 子标记与光合性状连锁，覆盖了所有的候选基因。在此基础上，4 个 SNP 分子标 记与木材性状成功连锁, 包括木葡聚糖转葡糖苷酶（XET ）, 生长素响应蛋白 （SAUR ）以及赤霉素调控蛋白（GASA ）。 最后，根据以上结论，我们绘制了 核基因组涉及光合作用的基因图。可见对于光合作用的调控，核基因组主要是起 间接地作用。其所涉及的调控主要可分为以下几个方面: 对叶绿体的调控（结构 和功能）,对能量的调控,运输的调控,各种代谢调控以及对于外界环境和不良状况 的防御。此外，我们推测提高杨树初级细胞壁的形成，可能对于提高杨树光合作 用效率有一定的积极意义。 毛白杨PtCesA5多态性与生长和木材品质性状的联合遗传学研究 徐煲铧 张德强* 北京林业大学生物科学与技术学院 100083 纤维素不仅是纸浆造纸的原材料，而且可以转化为乙醇这一重要的可再生新 能源。因此，研究纤维素的生物合成机制以及对其进行开发利用具有十分重要的 意义和生产价值。与一年生植物相比，树木具有多年生长、产品多样、易于储运 等优势。而我国优良乡土树种毛白杨更兼有分布范围广、适应能力强、栽培进化 史长、生态意义大等特点。此外，毛白杨的野生性强、遗传变异丰富，为开展林 木数量性状相关基因的单核苷酸多态性（SNPs ）研究和联合遗传学研究提供了有 利条件。纤维素合酶（CesA ）催化合成植物中的纤维素，众多的纤维素合酶组成 了一个庞大的蛋白家族。本研究从毛白杨未成熟木质部cDNA 中分离出纤维素合 酶基因PtCesA5,测序分析后，对其进行了组织特异性表达分析。随后在毛白杨自 然群体（n=480）中，挑选出最具群体分布代表性的的40株单株，分别克隆、测 序了其PtCesA5基因，并进行了SNPs分析和连锁不平衡（LD）分析。然后针对该 基因的SNP候选位点，对整个毛白杨自然群体进行了基因型检测，并结合该群体 毛白杨木质部中的综纤维素含量、α-纤维素含量、木质素含量、纤维长宽、微纤 丝角以及植株的树高、胸径等表型性状数据，进行了关联分析、LD分析等遗传学 6 统计关联分析。结果显示，毛白杨PtCesA5基因cDNA片段总长为3661bp，其内部 含有完整的蛋白质编码区，CDS总长为3240bp,可以编码长度为1079个氨基酸残基 的蛋白质。所推导的蛋白质氨基酸序列与美洲山杨CesA5、白桦CesA2和拟南芥 CesA3 的蛋白质氨基酸序列一致性分别为97%、92%和86% 。通过对PtCesA基因的 SNPs分析，检测到了164个SNP位点，SNP频率为1/42，其中常见SNP个数为43个。 对自然群体进行的单标记（single-marker）和单体型（haplotype ）关联分析结果 显示，在PtCesA5基因中，有2个SNP位点与综纤维素含量显著关联（P0.001）， 有1个SNP位点与微纤丝角和树高显著关联，有1个单体型与纤维长度显著关联。 对PtCesA5基因内SNP位点进行的LD分析结果显示, 随着核苷酸序列长度的增 加,SNPs 的连锁不平衡在基因内部迅速衰退,所以在毛白杨中基于PtCesA5基因的 LD作图是可行的。相比较而言，树木自然群体的关联分析研究也可以简化和缩短 林木育种过程。本研究发现了与综纤维素含量、微纤丝角、纤维长度等重要性状 显著关联的SNP位点和单体型，为选育出速生、优质的毛白杨优良无性系提供了 重要参考。为分离其他树种CesA5成员以及进行该基因的