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5个警用纯种犬品种遗传学研究
杨前勇叶俊华
忪安部南昌警犬基地南昌330100)
昆明犬、德国牧羊犬、马里努阿犬、罗威纳犬和杜伯文犬是中国广泛使用的警用纯种
犬品种,后四个品种也是世界各国常用的警用纯种犬品种,同时都属于中型犬品种,它们
之间有什么遗传背景,有何渊源,对于品种利用和改良、新品种培育都是很重要的课题。
tandem
微卫星DNA(microsatelliteDNA),又称短串联重复顺序(shortrepeat,S册,
是以核心序列为2--6bps的可变数量的高度串联重复多态性序列,存在于真核细胞基因组
内。微卫星DNA具有分布广泛、多态性丰富、易于检测、呈孟德尔共显性遗传等特点,是
目前最常用的遗传标记之一…。目前,国际上已广泛利用微卫星DNA的多态性进行犬种的
各项研究和应用。如亲子鉴定幢1、个体鉴定13’、遗传多样性分析n‘、系统进化学研究15’,以
及功能基因定位、遗传疾病连锁分析等,并且随着犬全基因组测序完成其应用范围还会更
为广泛。
本研究利用分布在不同犬染色体上的10个微卫星基因座对5个纯种犬品种进行遗传
学分析,根据此前报道,该10个微卫星基因座多态性丰富|6’。计算了基因频率、杂合度、
多态信息含量以及品种之间的遗传距离,根据各品种间的遗传距离建立NJ系统发育树,
分析它们的起源关系。
1材料和方法
1.1材料
本实验的品种有昆明犬81头、德国牧羊犬189头、马里努阿犬65头、罗威纳犬33
头和杜伯文犬3l头,均属于中型犬,分别来自公安部一级警犬繁育单位,采集外周静脉
血,抗凝处理,-20℃保存。
1.2方法
1.2.1基因组DNA的提取用常规酚一氯仿抽提法从静脉血白细胞中提取DNA。
1.2.2PCR扩增和3100遗传分析仪分析本研究使用美国应用生物系统公司(ABI)
的10个犬微卫星基因座的商用荧光分型试剂盒,扩增产物用ABl3100遗传分析仪电泳和
分型。
InformativeContent,PIC)哺1等遗传学参数计算公式见参考文献。
(Polymorphism
而 聚 类 分 析 软 件 则 从 专 业 网 站
252
行软件包中的neighbor.exe程序建立NJ系统发生树”‘
2结果
2l基因分型和多态性分折
图1 10个微卫星基因座峰值图
1 Genetic often
Fig analyzermap microsatelliteloci
两峰之间有一个很高的杂峰,同时F船079基因座经常出现影子峰。灵敏度也一般,只有
模板DNA的浓度在10ng到i00
ng之间效果才好。
表1 5个纯种犬品种10个微卫星基因座多态性
Table1 tenmicrosatelliteinfiye breeds
PolymorphisⅢof puredog
,^自^ #自i^
}自m
3
表1显示,该5个品种在10个微卫星基因座上平均等位基因数(n)在4.5到7
5431和0.7103
之间,平均杂合度(Het)在0.5836和07453之间,平均多态信息含量在0
之问。
表
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