DNA 定序技術之演進與發展.pdfVIP

綜 論 DNA 定序技術之演進與發展 李思元 1 莊以光 2 1 財團法人國家實驗研究院科技政策研究與資訊中心 2 永揚生醫科技股份有限公司 西元2000年首次完成了人類基因體草圖解碼的工作，為了加速基因資訊的充份利用，進而達成個 人化醫療的目標，DNA定序技術的發展將持續朝向低成本與高通量的方向前進。1990年代發展出 第一代定序方法，歷經30多年的演進，融合化學、生物化學、光學、自動化機械技術、微製程技 術與奈米技術等，開發出第二代高通量定序技術與第三代單一分子即時定序技術。本文彙整介紹 各世代定序技術的原理與特點，並加以分析比較，期望在瞭解DNA定序技術發展演進的過程後， 對未來新技術的發展創新有所助益。 關鍵詞：DNA定序、下一代定序技術、基因體、個人化醫療 Crick 由分子密度及X 光繞射的結果得知，DNA 分子 苷 是以雙股的去氧核醣核 酸鏈所構成。目前已知人類 前 言 苷 的基因組約由 60 億個核苷酸分子組成，每個核 酸 都含有下列四個鹼基中的一種，而 DNA 的雙股結構 苷 1984 年所提出的人類基因體計畫(Human Genome 藉由核 酸的鹼基，以腺嘌呤(adenine, A)配對胸腺嘧 Project, HGP) ，預計於1990~2005 年間，花費 30 億美 啶(thymine, T) ；胞嘧啶(cytosine, C)配對鳥糞嘌呤 元完成整個人類基因體定序的工作。令人驚訝的是 (guanine, G) ，並透過氫鍵的鍵結方式所構成，往後各 2000 年時，由私人企業團隊花費近 10 億美元，於 9 式 DNA 定序技術的蓬勃發展皆植基於此，並融合跨 個月內完成了人類史上第一次的基因體草圖解碼工 領域的工程技術而擴展出來[4] 。此外，核酸定序策略 作。爾後，隨著許多技術的發展與改良，解讀出一個 的擬定，考量構成基因組的核苷酸數目龐大，且受限 人類基因組序列的花費減低至約 2 千萬美元，然而， 於定序技術讀取長度的限制，無法一次完成所有的核 如此昂貴的費用無法讓基因資訊被充份利用，進而擴 苷酸定序，因而採用「分進合擊」的方式，先解讀各 展到個人化醫療的目標[1] 。因此，為了加速突破此項 片段的基因序列，再運用資訊科技協助進行片段接 價格障礙，美國國家衛生研究院設立「革命性基因組 合，達成整個基因組定序的目標[5] 。本文將依序介紹 定序技術」計畫，號召全世界科學家共同挑戰於 2014 DNA 定序技術的演進歷程與各階段主要技術平台之 年以 1 千美元的價格，完成讀取一個個人的基因組序 運作原理。 列[2] 。此外，美國「X Prize 」基金會舉辦了總獎金達 1 千萬美元的人類基因體定序競賽，台灣工研院資助 第一代 DNA 定序策略與技術 的「Cracker」團隊，發展互補性氧化金屬半導體(CMOS) 感測技術，以快速、低成本的定序方式，成為全世界 入圍的 8 個團隊中唯一的亞洲隊伍，挑戰「以每人 1 如圖 1 之概念圖所示，現行主要