中国人类基因组探究计划展望.pdfVIP

中国科协首届学术年会 特邀报告之十三 中国人类基因组研究计划展望 陈 竺 (上海第二医科大学附属瑞金医院、上海血液学研究所 国家人类基因组南方研究中心) 21世纪和一个新的千年即将来临。我国生命科学面临着巨大的机遇和挑 Genome 战，在举世瞩目的人类基因组研究计划(Human 如此。在这特殊的历史时刻，回顾HGP的不凡历程，展望其更加辉煌的未来， 对于进一步认识中国人类基因组科学界的历史使命和明确学科的发展战略， 是十分必要的。 一、HGP的科学成就和应用前景——从结构向功能过渡 堪与曼哈顿计划和阿波罗计划相提并论的人类基因组研究计划自1990年 正式启动以来，经过全球科学家的共同努力，已提前和超额完成了遗传和物理 作图，现已进入了大规模测序阶段，目前已完成了人类基因组约5％的测序．。 3x 定的2005年提前2年完成全部人类基因组DNA109碱基对序列的测定。 基因的识别也由于cDNA的大规模测序而明显加快。估计现已识别了90％以 上的人类基因，第一张人类基因组转录图(基因图)已经问世。与此同时，作为 模式生物体的大肠杆菌、酵母、线虫的全基因组序列已被获得，果蝇、小鼠和植 物(拟南芥菜、水稻等)的基因组研究也相继展开，预计在2005年将获得小鼠的 全基因组序列。一个在全基因组序列基础上的生物学研究新时代已经到来。 对人类和模式生物基因组的比较研究不仅有助于揭示遗传与进化的奥秘，而 且将最终为阐明人类基因组的结构、功能作出贡献。HGP又不仅仅是阐明生 命活动遗传学基础的纯学术研究，它对于人类疾病的基因诊断、基因治疗、基 因预防、新药开发、动植物品种改良、环境保护，乃至多个其他社会、经济领域 均会发生重大的影响。 值得指出，获知一个生物体的基因组序列仅仅回答了问题的一部分，更重 ～1一 要的是通过了解基因组与所处环境的相互作用来阐明其功能。实际上，过去2 —3年中功能基因组学(functional genomics)已被提上议事日程。由于基因组的 结构和功能之间并无一道鸿沟，随着HGP的内涵及外延在不断地扩展，HGP已 开始了由结构基因组学向功能基因组学过渡、转化的过程。当前，在功能基因 组研究中可能的核心科学问题一般认为有基因组的多样性和进化规律、基因 组的表达及其调控以及模式生物体基因组研究等，而研究的方法则包括了通 过生物信息学手段直接比较和分析序列模式来推断功能，对mRNA和基因蛋 白质产物的大规模分析来阐明基因组水平的表达规律，运用各种通过破坏基 因结构的手段从整体上研究其功能等。正如美国人类基因组新的五年计划所 指出的那样，HGP在这个方面要做的工作，是加强对能够大规模而高效地应用 并能够将基因组作为一个整体来产生完整数据的技术的开发。根据现有资源 的情况，应该推广的现有方法和应该支持的新的技术观念包括：开发cDNA资 源、支持对非蛋白质编码序列分析方法的研究、开发基因表达的综合分析技 术、改进基因组水平致突变的方法和开发整体蛋白质分析技术，大规模识别基 因转录本及其蛋白质产物。 二、中国的HG／X必要性、可能性和已有进展 HGP对生物学和医学在下一世纪可能产生的革命性作用，一开始就受到 我国生命科学界尤其是遗传学界的高度重视。我国的HGP在老一辈遗传学家 谈家桢、吴曼先生的倡导下，得到了国家自然科学基金委员会和高技术计划的 支持。受投资强度所限，我们没有走国外的全基因组或整条染色体作图、测序 的路线，而是根据我国人群资源优势的特点，突出基因组多样性研究和疾病基 因识别，并围绕这两方面目标引进国际人类基因组研究的新技术，同时在工作 中积累经验，为局部基因组DNA的作图、测序奠定基础。以这一基本思路为指 导，先后在1993年和1997年启动了“中华民族基因组中若干位点基因结构的 研究”和“重大疾病相关基因的定位、克隆、结构与功能研究”。在1993—1997年 的第一阶段，主要安排了：(1)