DNA-喜树碱复合物NMR研究.pdfVIP

2001年增刊 分析试验室 Vol.20.Suppl 2001年11月 ChineseJournalofAnalyticalLaboratory 2001-11 DNA一喜树碱复合物的NMR研究 张友杰，陈 嵘，阎江丽 (华中师范大学分析测试中心，武昌430079) 摘 要:应用二维NMR技术和距离约束分子动力学计葬方法研究了。NAd(GGTATACC),一喜树碱复合物在浓液中的构象. 对其中昨交侠质子的化学位移作了指定.根据该复合物与d(GGTATACC):之ht的化学位移之崖和NOE强度 (空间距离〕的 差别，对该复合物的可能构象进行了讨论. 关键词 DNA-药物复合物毛DNA;喜树钱;NMR 温度恒定在290.2K(士0.1K),采用Bruker标 从80年代后期到%年代，有些学者应用NKR 准脉冲序列，用预饱和法压制水峰，TPPI方式采 二维谱方法研究了药物一。NA的相互作用w。但这 样。 些药物均为抗生素类西药，如诺加霉素 结构计算采用距离约束分子动力学方法，在 (nogalamycin)、道诺霉素 (Daunomycin),醒每 Indigo工作站上完成.计算程序为SYBYL6.1软 素 (Quinomycin)、放线菌素D(ActinomycinD) 件包中分子动力学模块.质子间距离的半定量计 等等，却没有天然药物。喜树碱 (Camptothecin) 算用Fortran77自编程序完成。 是我国特有的琪确科旱莲属植物喜树的种籽或树 2结果与讨论 皮中提出的一种生物碱。它对多种肿瘤都具有抗 首先我们通过串行或顺序路径 (Sequential 癌活性，可以抑制DNA和RNA的合成121。本文采用 Walk)法归属了DNA及其与喜树碱的复合物中非 低聚核昔酸d(GGTATACC):与喜树碱作用形成复合 交换质子，并确定了它们的化学位移。某些质子 物，通过一维和二维NMR技术和距离约束分子动力 的化学位移及质子间距离的变化见表1所示。 学方法研究了该复合物在溶液中的可能构象。 由下表可知，d(GGTATACC):与喜树碱的作用 1实验部分 是很明显的。喜树碱插入到d(GGTATACC):的GG d(GGTATACC):样品由上海细胞研究所合成并 (CC)碱墓对之间，从而形成了分子复合物，即 纯化，制成约0.5。mol/L浓度的重水溶液。 夹嵌物(intercalator)，见图to 喜树碱粗品购自黄石第三制药厂，经多次重结晶 纯化后得淡黄色针状晶体。一维和二维NMR实验 均在中科院武汉物理所的ARX-500谱仪上完成。 Table1.MainChangesofSpaceDistances(r.nm)ofSameProtons d(GGTATACC)2-CamptothecinComplexandd(GGTATACC)2 t(x复合物}0.287 00.3.38017 0.367 r(ij)(QN丛 2001年增刊 分析试验室 Vol.20.SuppI 2001年11月 ChineseJournalofAnalyticalLaboratory 2001-11 Fig.IStructureSchemofinteractionbetneend(6GTATACC),aidCw tothecin 参考文献 、 0 I i godeoxyribonucleotide d (GGTA