猪Six1基因启动子多态性和胴体和肉质性状间的关联分析.pdfVIP

猪Six1基因启动子多态性和胴体和肉质性状间的关联分析.pdf

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ANIMALBIOTECHNOLOGYBULLETIN 63 2010,VOLUME12,N0.I 猪.妣J基因启动子多态性与胴体和肉质性状间的关联分析‘ 吴望军,熊远著,雷明刚,左波,徐德全,任竹青 (农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室农业部猪遗传育种重点开放实验室, 华中农业大学,武汉430070) 引言 Sixl基因是一个与肌肉发育相关的重要调控因子,研究表明,Sixl基因对MRFs家族成员 具有重要的调控作用。此外,研究发现Sixl基冈可以促使慢肌快肌转变。因此,本研究将 Sixl基因作为影响猪骨骼肌的生长与猪肉品质的一个重要的候选基因来研究。 材料方法 本研究以大白与梅山猪基因组DNA为素材,设计特异性引物(SPlF: 动子进行SNP扫描。并利用此对引物,采用PCR-RFLP的方法对启动子中的一个SNP位点进行 了进一步的分析。对该位点在大自、长白、皮特兰与杜洛克四个国外猪种与梅山、清平与合 作三个中国地方猪种的遗传多样性进行了检测。同时对该位点在两个大白×梅山猪F2代资源 群的多态性进行了检测,并进行了性状关联分析。 结果 引物所扩增的目的片段为845bp,在第178bp处发现了一个C.T颠换突变,并引起了A/UI 酶切位点的改变。PCR产物经爿几17I酶切后产生三种基因型,CC基因型有417bp,305bp, 的判别带型。等位基因频率显示,C等位基因在中国地方品种占优势,而T等位基因在国外 品种占绝对优势,关联分析结果如表1所示。 表lSixI基因AIUI.RFLP多态性与胴体和肉质性状的关联分析 注:上标1代表最d,--乘均值.a-标准误,数值上标的字母相同表示差异不显著,字母不同时,大写字母表示 差异极显著,小写字母表示差异显著;上标+表示p0.05,++表示p0.01. 讨论 关联分析结果发现CC基因型的个体肉色值要显著高于TT个体(P0.05),而C等位基 因在中国地方品种是占优势的,这与中国地方猪种比外国猪种具有更高的肉色值是相符的, 这也表明c等位基冈有利于肉色的改善。而CC基因型的个体具有最高的瘦肥比例,也意味 着CC型的个体可以在一定程度上提高瘦肉的比率。但这与T等位基凶在国外品种占优势并 不相符,可能的解释就是这个SNP位点并不是真正影响瘦肉含量的位点,而只是与影响瘦 肉含量的突变位点紧密连锁。另外,CT基因型的个体具有最高的肌内脂肪与背膘厚 (P0.05),由此可以看出,CT基因有利于肌内脂肪的提高,但同时也增加了背部脂肪的 含量。总而言之,本研究初步鉴定了猪Sixl基因启动子的多态性与生产性状相关。 基金项目:国家重点基础研究发展规划项目(2006CBl02102)

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