我国分子育种迎来高通量时代——记中玉金标记分子标记实验室.pdfVIP

S哑 黜器■ 我国分子育种迎来高通量时代 记中玉金标记分子标记实验室 ◇丝 羽 近年来，随着生物技术迅猛发展 ，我 国育 种家利用高通量测序、分子标记等等先进 的生 物技术和信息技术手段 ，架起 了种质基 因资源 信息衔接庞大数据 的桥梁 ，建立起常规育种与 生物育种相结合 的平 台，大幅度提高了育种效 率 ，使 育种工作 实现 了由 “经验”向 “科 学”的根 本性转变 。 为了让分子标记技术和基 因组测序技术带 动我国种业的发展，中玉金标记 (北京)生物技术 股份有限公司于2014年投资5500万元 ，初步 建立 了目前我 国最先进、通量最高的分子标记实 验 室 。 在 中玉金标记分子标记实验室里 ，国内外 平 台为核心组建 了分子育种实验室 ，已初步建 种业科研精英正在为我 国种业创造着无限动 立起来一个我国技术水平和通量都很高的分子 力；在这里，我国传统育种落后3O年、分子育种 标记检测体系。 落后 20年的现状将被改写。 据实验室工程师介绍 ，4大平 台相互协 同 “实验室 的建立为我 国的种业公司和育种 运行 ，从而使中玉金标记实验室拥有了每天产 单位利用基 因组学的最新研究成果有效提高育 生 200万个 以上基因型信息数据点的能力；高 种效率和精确性提供了基础 ，可以说它承担着帮 通量 DNA提取和分子标记检测平台，处理能力 助提高我国种业研发能力与产品开发核心竞争 达到年处理样品 100万份以上；承担的各项定 力的重大使命”，实验室首席科学家卢洪说。 制项 目，年产生数十亿个SNP数据点。同时，实 验室计划购置全球 先进的 IlluminaNextSeq500 技术水平 已经达到国际水平 高通量测序系统 ，应用其测序可获得测序长度 为 2x150bp，每张Howcell每次产生的最大数 分子标记技术和基因组测序技术的进步极 据量为 100～120G，运行一次 的时问为 29h，运 大地推动 了分子生物学和现代农业科技的发 行一年的数据产量为 29T。NextSeq500不仅可 展 。近 1O年来 ，基于分子标记技术的高通量基 以进行基因组测序 ，同时可以用来进行转录组 因型和第二代 DNA测序技术的应用，使生物学 深度测序、甲基化高通量测序 、染色质免疫共沉 的研究更加高效、广泛、深入 。技术的进步使单 淀测序和小RNA高通量测序研究。实验室已经 个数据的生产和管理成本急剧下降，基因组的 初步具备了应用KASPar和 TaqManSNP基因分 研究和应用进入了 “大数据”时代 ，给分子生物 型技术，为我国种业同仁提供高通量分子标记 学家 、遗传学家、育种家等提供了海量信息。 分析 的能力。 卢洪介绍 ，目前 以高通量 DNA提取平 台、 “可以说 ，目前我们的分子标记实验室的技 高通量分子标记开发平台、高通量分子标记检 术水平 ，与国际一流水平的分子实验室相 比毫 测平台，以及高通量 SNP芯片检测平台等 4大 不逊色”，卢洪说。 · 15 ． ■SaE舰 EcH 为育种企业提供高端技术服务 委托，我们已完成对全 国3000多份育种材料 的遗传分析和杂种优势群划分，对种子公司更 分子育种是当今最前沿 的育种技术 ，不过 ， 准确地利用现有种质资源有很大帮助 ，避免靠 也被认为是 “最烧钱”的。一台设备动辄几百万 经验和表型检测带来的不准确性和盲 目性 。”罗 元，而且每隔3~5年就要更新换代 ，设备费用十 朗介绍，“我中心的科研成果可 以有针对性地改 分昂贵。更主要的是，对普通的科研单位和育种 良和提高国内优秀玉米杂交 品种 的抗病能力 ， 企业来说，实验数据量