利用核心简单重复序列(SSR) 标记分析无籽西瓜品种的DNA 指纹及遗传多样性.pdfVIP

Online system: 农业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2014, 22(2): 188~194 DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2014.02.007 利用核心简单重复序列(SSR)标记分析无籽西瓜品种的DNA 指纹及 遗传多样性 赵胜杰 朱红菊 路绪强 何楠 刘文革* 中国农业科学院郑州果树研究所 河南省果树瓜类生物学重点实验室 郑州450009 *通讯作者 liuwenge@ 摘 要 为构建无籽西瓜品种的DNA 指纹，实现无籽西瓜品种的快速准确鉴定 客观评价品种的遗传多 样性 本研究利用核心SSR 标记对我国54 份无籽西瓜(Citrullus lanatus)主栽品种进行了分析。结果显示 23 对多态性引物共扩增出63 种 因型 因型数2~5 个不等 平均2.74 个；平均多态性信息量(PIC)为 0.39 变化范围为0.04~0.67，有5 个品种具有特征谱带；54 个品种遗传相似系数变化范围为0.643 9~ 1.0 平均0.859 3 参试品种具有较高的遗传相似性；组合23 对引物，除无法区分雪峰花皮无籽与郑抗无籽1 号、郑抗新1号与广西3 号、黒宝无籽与桂冠1号 其余品种均能一一区分开 利用PIC0.4 的10对引物构 建了5 份主要参试品种的DNA 标准指纹图谱； 用类平均法进行聚类分析,在相似系数0.82 处 可将54 个品种分为7 大类。本研究建立了参试品种的标准DNA 指纹图谱 为我国无籽西瓜品种的真实性鉴定 和知识产权保护提供了技术 础。 关键词 无籽西瓜品种 核心SSR DNA 指纹 遗传多样性 Studies on DNA Fingerprinting and Genetic Diversity of Seedless Watermelon(Citrullus lanatus) Varieties Using Core Simple Sequence Repeat(SSR) Markers ZHAO Sheng-Jie ZHU Hong-Ju LU Xu-Qiang HE Nan LIU Wen-Ge* Key Laboratory of Henan Fruits and Cucurbits Biology, Zhengzhou Fruit Research Institute, Chinese Academy of Agriculture Sciences, Zhengzhou 450009, China * Corresponding author, liuwenge@ Abstract In order to construct the fingerprinting of the main seedless watermelon(Citrullus lanatus) varieties to achieve fast and accurate identification and evaluate the genetic diversity, core simple sequence repeat (SSR) markers were used to study the DNA fingerprinting and the genetic diversity of 54 seedless watermelon maj or varieties in China. Twenty three polymorphic primer pairs could amplify 63 genotypes, and 2.74 genotypes were detected by each primer pair with the range from 2 to 5. The p olymorp hic inf ormation content (PIC) values r