微生物蛋白质组学研究进展.pdfVIP

卷 期 ! 微 生 物 学 报 $% ’! ,% ’ 年 月 ## ! !#$ %’()(*(+$ ,-$ ()*+ ## !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!! 微生物蛋白质组学研究进展 吴谋胜 彭宣宪 （厦门大学生命科学学院细胞生物学与肿瘤细胞工程教育部重点实验室 厦门 34-##1 ） !#$%% ’( )’*#+’,- !#.%#/’* 56 7%689:; =:; 6?;@+?; （ ， !# $#% ’()*’+)*% ), -./0’+1)2 31214+*% , )* 5#66 71)6)8% ’2. !/9)* 5#66 -2812##*128 ， ， ， ） :0))6 ), 1, # :01#20#4 ;1’9#2 21=#*41+% ;1’9#2 34-##1 512’ 关键词：微生物蛋白质组学，定量蛋白质组学，比较蛋白质组学，亚质白质组学，基因组学， 生物信息学 中图分类号： 文献标识码： 文章编号： （ ） A2- ( ###-24#. ## #2#1-2#! 微生物基因组研究作为人类基因组计划的一部分，对人类基因组计划及微生物学，甚至整个生命科 ［］ 学都产生巨大的影响- 。人类基因组测序已经取得突破性进展，现已绘制完毕人类基因组的工作草图， 人类基因组计划即将提前完成。目前已采用 芯片和基因表达序列分析（ B,(C D,( 8:*+? ?;?E8+8 %F :;: ［，］ 3 ， ）来研究基因组的功能 。但随着对基因组研究的深入，人们认识到单纯从基因组信息 :@)*:88+%; G(HI 并不可能完全揭示生命的奥秘。因为蛋白质是生物功能的体现者，这使我们不得不考虑基因编码的蛋 白质有什么功能。不仅如此，基因在转录、翻译后产生蛋白质的过程中，存在着转录水平、翻译水平的调 控，蛋白质往往还要经过剪接、修饰加工之后，最终才成为有功能的蛋白质，而且不同组织、不同的分化 程度、在不同环境下，生物体所表达的蛋白质是不同的。所以单纯从基因组水平上并不能完全揭示生命 ［］ 活动规律。在这种背景下，蛋白质组学（ ! )*%J:%K+L8）应运而生 。蛋白质组学研究主要采用二维电泳技 ［］ 术，生物质谱技术和生物信息学等工具1 。 微生物蛋白质组学研究的基本目标是鉴定与微生物活动相关的蛋白质。在不同的环境条件下，微 生物相关功能基因组得到表达。用二维电泳将其大量的蛋白质进行分离，比较二维电泳图谱的差异，再 ［］ 对这些差异蛋白质进行鉴定，可以确定与微生物生理活动相关的基因，从而阐明微生物基因组功能4 。 对微