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四川野生斑茅居群遗传结构的SRAP分析
张瑜1 鄢家俊2 白史且12’彭燕1 梁绪振2 张建波3张劲2胡超4
(1.四川农业大学草业科学系,四川雅安625014;2.四川省草原科学研究院,四川成都61173l;
3.贵州省草业研究所,贵州贵阳550006;4.重庆市垫江实验中学,重庆408300)
摘要采用SRAP标记分析了12个源于四川境内长江主要支流(岷江、青衣江和沱江)流域野生斑茅
将12个斑茅居群分为4类,来自同一流域的材料优先聚为一类。本研究通过对斑茅遗传多样性、遗传结构
及聚类结果的分析,推测斑茅是一种异花授粉的广布种,说明了河流影响斑茅居群间基因交流的作用。
关键词斑茅;sRAP;遗传多样性;遗传结构;聚类分析
抗逆性强等优良特性,常生长在路边坡地、河岸涧溪甚至砾石荒滩上,海拔范围0—1500m,我国热带、亚热
带地区以及印度、缅甸、越南等东南亚国家均见其广泛分布。作为甘蔗的近缘种,斑茅在起源上与蔗茅属
(E砌眦J|1wMichaux.)、甘蔗屑(Is眦矗砌m
有很大的相关性,一起被定义为“甘蔗属复合体”。斑茅具有抗逆性强、宿根等优良特性且能与甘蔗天然杂
交,其作为甘蔗品种改良的重要基因库,在甘蔗育种中具有重要作用,国内外陆续开展了相关研究,获得了大
量的杂交新材料,为甘蔗品质改良作出了巨大贡献。近年来,由于斑茅生物量大且能广泛适应南方荒山荒
坡、盐碱地、沿海滩涂等边际土壤而受到能源草育种者的广泛关注。
斑茅在甘蔗品质改良和能源草选育上具有广泛的利用价值,但目前对其遗传多样性上的研究非常有限,
研究中发现我国斑茅具有丰富的遗传多样性,且大陆性国家(中国、印度等)斑茅的遗传多样性高于海岛国
家(菲律宾、印度尼西亚等);对其遗传结构的研究仅见zh锄g等的研究,斑茅遗传多样性和遗传结构上信息
的匮乏严重制约了该物种选育与利用。深人此类研究对了解斑茅的遗传背景、指导其种质资源开发与利用
有重要意义。SRAP分子标记技术已经在牧草、草坪草的遗传多样性研究上得到了广泛应用,刘君等利用
sRAP对九个狗牙根进行了品种鉴定分析,凌瑶等研究了野生狗牙根的遗传多样性;张宇等通过sRAP标记
对紫花苜蓿与黄花苜蓿进行分析,表明其具有较高的异质性。为更好的揭示四川野生斑茅居群的遗传多样
性及遗传结构信息,本研究利用SRAP标记技术分析了12个分布于岷江流域、青衣江流域和沱江流域野生
斑茅居群的遗传多样性及遗传结构,以期了解其遗传多样性水平及遗传分化情况,为该区域野生斑茅保护、
基金项目:国家高技术研究发展计划(“863计划”)项目——甘蔗属等新型能源草种质资源挖掘与评价技术研究
(2012AAl0180l—01)
163.como
%通讯作者:白史且,E—mail.b“shiqie@126,com
’M1
开发利用和遗传育种提供依据。
1材料和方法
1.1 供试材料
共12个野生斑茅居群,其中采自岷江流域7个,青衣江流域2个,沱江流域3个,具体分布情况见表1。
省草原科学研究院能源草育种基地保存。
1.2基因组DNA的提取
GenomicDNA
采集材料的幼嫩叶片,采用Plant l(it植物基因组DNA抽提试剂盒(北京天根生化科技有
限公司)提取斑茅总DNA,利用NaJloDr01)ND一1000
mmoL/L
测DNA浓度。0.I×TE缓冲液[Immol/L惭s—HCl,0.1EDTA,pH值8.O]将DNA稀释至25n∥
止,储存于一20℃冰箱内,供下一步使用。
表l 12个斑茅居群基本信息
路边灌丛
SL 双流Shuan出iu 550 30。24.005’103。54.004’ 0f
Shmbroadside
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