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2017-08-11 发布于安徽
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基于原核生物基因组及系统发育分析发现莽草酸通路的起源过程可能蕴藏趋同与趋异两种进化模式.pdf

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基于原核生物基因组及系统发育分析发现莽草酸通路的起源过程可能蕴藏趋同和趋异两种进化模式职晓阳1* 姚继成1李宏伟1,2 李文均1，3* （1.云南大学云南省微生物研究所西南微生物多样性教育部重点实验室昆明 650091 2.曲靖师范学院生物系曲靖 655000 3.中国科学院新疆生态与地理研究所中国科学院干旱区生物地理与生物资源重点实验室乌鲁木齐 839911 摘要：尽管莽草酸通路在生物合成和代谢研究方面一直受到广泛关注，但目前关于该通路的起源和分子进化的研究鲜有报道。为了揭示莽草酸通路相关蛋白的早期进化关系，我们以隐马尔科夫(HiddenMarkovModel)模型为基础结合新的生物信息学方法，对莽草酸通路在1294 个原核生物基因组中的分布和系统发育关系进行了分析，结果发现该通路在原核生物的共同祖先(LastUniversalCommonAncestor,LUCA)还未产生细菌和古菌的分歧之前已经广泛存在，且起源过程吻合之前关于代谢通路起源的拼凑假说(patchworkhypothesis)。关键词：莽草酸通路;原核生物基因组;拼凑假说;趋同进化;趋异进化