基于整合信息学策略研究鸡生长和繁殖性状候选基因的遗传效应.pdfVIP

第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集 基于整合信息学策略研究鸡生长与繁殖性状候选基因的遗传效应 欧江涛，唐韶青，李耕，孙东晓，俞英，张毅，王雅春，张沅‘ 93 中国农业大学动物科技学院，北京1001 关键词：鸡；重要经济性状；候选基因；单核苷酸多态性；整合信息学策略 引言 生长和繁殖由多基因控制，受遗传、营养和环境等因素影响，是家禽工业生产中两类最重要的经济性状。 如何将这些复杂性状质量化，鉴定和利用与其显著关联的、潜在的候选QTLGene和QTN，将日趋重要。其 中，采用“整合信息学策略”对候选基因进行筛选与鉴定是行之有效的办法。本研究利用这种策略对生长轴相 关因子，通过理化功能、文献组学、信号通路、电子差异显示、生物调控网络和QTL定位等方面的信息进行 的分子遗传效应，以期获得有效标记，应用于鸡的辅助育种或分子育种中。 材料方法 术，从基因组变异、基因与蛋白质互作、蛋白激素变化等多方面、多层次研究这些基因的遗传效应以及与生 长和繁殖性状的相关性。 结果 IGFBP3 G4533815A 和STAT5BSNP分别增加了新的Nkx．2．5和CREB转录因子结合位点，转录因子与 周龄4个阶段间差异极显著(P0．01)，而SNP各基因型间不显著，这可能由于测定样本数少的缘故。 讨论 长性状，也与繁殖性状有关。其次，候选基因的“整合信息学策略”主要包括5个方面的内容：比较组学、位 置候选、功能候选、电子候选、文献组学等策略，通过整合策略的使用，并结合表型测定和适宜的统计模型 分析，这极大地提高了候选基因对所研究表型的针对性、可靠性、重复性和关联性。使得候选基因法在动物 遗传育种与繁殖研究中，不断变得更加经济而有效。最后，通过池DNA测序法筛选SNP，并结合改良的 型分析，可大大降低劳动时间和成本。 致谢 本研究受“973”项目(2006CBl02107)资助。感谢国家家禽测定中心的工作人员对本研究的帮助。 一48—