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山羊Six3和Six6基因遗传变异及其对生长发育性状的影响
蓝贤勇1淮永涛1,姚大为1,蔡含芳1潘传英2,雷初朝1陈宏1’
(1.西北农林科技大学动物科技学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨凌,7121的;
2.西北农林科技大学生命学院,陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨凌,712100)
关键词:山羊Six3基因:Six6基因;遗传变异;生长发育
引言
同源异型框基因Six3和Six6基因均属于Six基因家族成员,它们广泛地表达于脊椎动物的许多
组织中,且在调控胚胎正常的形态发育、器官发育及细胞的分化方面扮演着重要的角色。Six3和Six6
基因属于腺垂体分泌过程中的核心转录调控因子,主要参与调控体内一些发育相关基因的表达,据
此推测,这些基因遗传变异或SNP位点在动物生产实践中对胚胎形成、生长激素的调控和垂体分泌
等具有重要的作用。寻找与山羊生长发育性状相关的分子标记对于通过MAS培育优良品种至关重
等现代技术研究8个山羊品种这些基因的遗传变异及其对生长发育性状的影响,为目前相对滞后的
山羊遗传育种研究提供科学资料。
材料与方法
n=22)。生长发育性状包括成年体重和体尺数据。因NCBI数据库中没有山羊基因组序列,故根据
007308)分别设计5和6对引物,扩增
牛Six3基因序列(No.NC007309)和Sxi6基因序列(No.NC
变位点进行分型,利用PopGene和SPSS软件分别进行群体遗传学和关联分析。
结果
列比对后首次发现在Six6基因第1内含子有1处CT突变。由于该突变不能改变任何酶切位点,因
样本进行遗传变异检测,发现CC、CT和TT三种基因型。群体遗传学分析表明,C/T等位基因在
体管围显著优于CC基因型。
讨论与结论
关于Six3和Six6基因遗传变异研究,多见于人、小鼠、海洋鱼等生物的体外表达分析,且常被
作为器官机能缺陷和重要的疾病预测相关的候选基因,而鲜见于家畜和家禽SNP分析,目前在山羊
中还未见相关报道。本研究未发现山羊Six3基因存在在遗传变异位点,但在Six6基因中仅发现第l
内含子中存在突变,可能与这两基因极其重要的功能有关。关联结果暗示,该基因对后期生长发育
性状影响不大,仅对管围有显著遗传效应,可能与它作为一个基层发育调控基因有关,Six6主要在
胚胎发育期对垂体的正常发育产生影响,从而在未出生之前对犊牛的生长发育起到调控作用有关。
致谢
本研究由西北农林科技大学“青年学术骨干支持计划”(QNGG.2009.007)、国家863
(2008AAIOZl38)和教育部高校博士点基金(No.200807120012)。
奉通讯作者:chenhon91212@263.net
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