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统计遗传学、数量遗传学和生物信息学 利用果蝇进行数量性状分子标记效应解析 李新海，王翔宇，阎辉，邓学梅，吴常信 中国农业大学动物科技学院，北京100193 关键词：果蝇；体重；标记辅助导入 引言 在动物数量性状标记研究与应用中，经常出现标记效果不理想的情况。原因是多方面的，其中标记与QTL 连锁紧密程度是一个重要影响因素。本研究在果蝇中发现一个与小体重密切相关的标记(黄体，yellowo，yO)， 该标记为x染色体端部一个隐性突变，使果蝇体色由野生型的灰色变为黄色。围绕着果蝇这一小体重标记， 研究不同遗传背景下标记对数量性状效应的稳定性；并对普通野生型群体进行标记辅助导入，检验标记辅助 选择的效果；对标记区域的序列进行分析，初步解释了标记分子结构与小体重性状的关系。该研究对遗传标 记在育种应用中遇到的效应不稳定问题给予了一种解释，对标记辅助选择的理论和应用具有借鉴作用。 材料方法 h)；统计分析：应用SAS 果蝇品系：yO，yl，OR，W，e，BJ；测定性状：果蝇刚羽化体莺(羽化后3—16 bp的序列做探针。 公司地高辛试剂盒，利用Y基因外显子2上一段710 结果与分析 用带有y0标记的果蝇品系与四个非y0品系(体色为野生型灰体)进行F2正反杂交，对每个组合F2个体 按性别分开，分别分析它们中黄体与灰体刚羽化体重的差异，发现12个体重差异比较中，所有黄体(携带、r0 标记的纯合个体)果蝇均小于同组、同性别野生型果蝇，其中有11个达到了显著水平。这一结果说明，在v0 品系与不同品系杂交，产生不同遗传背景的情况下，y0标记与小体重始终是相关的，即这一标记效应没有随 遗传背景的改变而消失。经估计，标记效应在雌雄中均达到0．5个表型标准差。通过标记辅助导入的方法，将 cM的W标记(使果蝇眼睛颜色 含有y0标记的DNA片段导入到野生型背景中，再利用与y0标记相距仅1．5 由野生型的红色变为白色)进行二次标记辅助导入，使得导入的DNA区段小于1．5cM，从而得到了含有约 1．5cM y0标记区段，而其它染色体区域与野生型品系相同的标记辅助导入品系，分析结果表明新育成品系的 雌、雄果蝇体重分别比原始的野生型品系降低13．2％和9．4％。证明，yo标记不仅对果蝇体重有稳定的降低效 43 kb的大片段缺失，这一缺失区段中包含黄体Y基因，因此表现出黄体表型。考虑到黄体突变还有其它的等 位基因，本研究引入了yl品系(y基因起始密码子单碱基插入导致Y单个基因失效的突变)。利用y1品系进 行了与上述yO品系相同的F2杂交及标记辅助导入分析，结果发现，y1标记没有表现出稳定的小体重效应。 讨论 本研究利用F2杂交、单标记和双标记辅助导入杂交逐步证明了果蝇y0标记对其体重效应的稳定性和标 记辅助选择的有效性。说明数量性状的标记辅助选择是可以成功的。但是我们在研究中也发现，同样是黄体 标记，在y1品系中其效应的稳定性却明显地差，而且标记的效应值也较低。这使我们联想到大动物QTL标 记或基冈在不同育种群体中也有过不同的报道，同一个标记效应大小不同，甚至在某些群体中无效。根据本 研究提示，可能QLT标记存在着多个等位基因，而真正有生物学意义的等位基因是标记辅助选择成功的关键。 比如yO品系43kb的缺失造成黄体表型，yl品系单碱基的插入也造成黄体，我们却发现前者的黄体对体重选 择有效，而后者无效。因此可以看出尽管两个标记很相似，但它们的效应差异却很大，同基因座位上等位基 因的效应差异可能足遗传标记看似不稳定的原因之一。 致谢 本研究受国家“973”项目(2006CBl02101)和“863”项目(2008AAl01002)资助。 一59—