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土壤微生物生态过程与分布格局 贸纪正 中国科学院生态环境研究中心 微生物是地下土壤生态系统的核心，主要充当分解者的角色，对其中有机物的分解与转 化、养分循环与利用、土壤肥力形成与稳定等起着关键作用。地下生态系统与地上生态系统 之间紧密联系，相互依存，共同决定着陆地生态的特征、过程和功能。土壤微生物组成复杂， 类群繁多，数量巨大，功能多样。对土壤微生物群落多样性特征、分布格局、重要元素循环 的生态过程等的研究，随着分子生物学技术的迅速发展和应用，受到生态学、微生物学和土 壤学等领域学者的重视，成为相关领域的研究前沿。 近年来，我们将一系列微生物分子生态学实验技术，用于研究长期生态定位试验站土壤 微生物多样性组成和结构，碳、氮等元素循环转化的生物学过程与机理，以及微生物分布的 生物地理学特征和多重生态功能特点。发表SCI论文50余篇，SCI引用400余次，出版英 文专著l部，组织出版FEMSMicrobiologyEcology中国主题专刊1期，在国内外微生物 生态学领域产生了一定影响。 (1)对土壤中氨氧化古菌(AOA)和氨氧化细菌(AOB)的丰度及组成进行了系统研究，发现AOA 的丰度大于AOB，AOA和AOB组成对环境变化的响应有所不同，研究成果发表于Nature Geoscience、Environmental Microbiology等国际微生物领域的主要杂志。 氨氧化作用是硝化作用的第一个反应步骤，也是限速步骤，是全球氮循环的中心环节。 自19世纪末发现细菌氨氧化作用以来，AOB一直被认为是土壤中好氧氨氧化的唯一微生物 类群。近年，这一认识经历了革命性的突破。2004年对海洋微生物基因组测序分析发现， 某些古菌也带有氨氧化基因。2005年更是从海洋中分离了一株氨氧化泉古菌仉 在，且其丰度大于AOB至3000倍。我们率先对酸性土壤氨氧化古菌(AOA)进行了研究，首 次发现AOA对长期施肥所导致的土壤性质(尤其是酸度)的变化更敏感。在此基础上，又先后 对碱性土壤和水稻土中AOA和AOB丰度、组成及其对环境的响应进行研究，在国际上首次发 现碱性土壤AOA丰度也大于AOB，但其AOB对环境变化的响应比AOA更敏感：发现水稻土根 际AOA丰度及AOA／AOB比值比非根际更高。这些研究成果对认识土壤氨氧化过程、制定农业 土壤N素管理措施、乃至重估全球N循环都具有特别重要的意义。这些研究成果有1篇发表 其中 于NatureGeoscience。3篇发表于EnvironmentalMicrobiology，并被广泛引用， He等(2007)发表在Environmental Environmental Microbiology2007年以来发表文章的SCI引用第一名。 (2)将土壤微生物分子指纹特征与先进的统计分析相结合，发现土壤细菌多样性分布的区 域特点，并首次给予定量描述，研究成果发表于自然出版集团(PNG)出版的国际微生物生态 ISME 学杂志(The Journal)等刊物上。 现代微生物生物地理学理论认为，环境扰动和历史进化是造成当前微生物多样性变化的 两类主要因素。然而，对于这两类因素在当前微生物多样性分布格局形成过程中的相对作用 大小知之甚少。我们采用分子生物学方法(PCR—DGGE)测度了取自三个长期农业生态试验站的 212个土壤样品的细菌多样性指纹特征，结合先进的统计技术，考查了大尺度下环境扰动和 历史进化对微生物多样性的相对影响。多元回归树(MRT)和集合推进树(ABT)分析表明，代表 历史进化因素的土壤类型(取样点)和剖面层次(0-20和20—40厘米)对土壤细菌多样性变化 的贡献约60％，而代表环境扰动因素的取样时间和施肥处理(单独或结合施用无机肥和有机 肥)对土壤细菌多样性变化的贡献约20％，另有约20％的贡献来自本研究尚为考察到的环境因 17 子。这表明历史进化是驱动大尺度下(约1000公里)土壤细菌多样性变化的主控因子，同时， 现代环境扰动也可造成局部(如同一生态试验站内)土壤细菌多样性的变化。该成果发表于 TheISME Journal(国际微生物生态