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基于OBP1的酰基哌啶类驱避化合物的构效关系研究
陈文雅 王珊珊李冬玲彭炜段红霞杨新玲
中国农业大学理学院应用化学系PMDD实验室 北京100193
摘要:本文利用SYBYL7.3软件对具有驱避活性的酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白OBP1结合模式进行
研究,发现二者之间的相互作用主要是水桥作用和疏水作用.基于二者结合模式得出酰基哌啶类化合物
的构效关系为:当哌啶环上取代基大小和位置一定时,驱避活性随酰基C上碳链长度的增加先增大后减
小,含9-10个C活性最佳;当酰基端碳链长度一定时,在哌啶环上引入大取代基对活性不利.这一研
究为基于靶标OBP1合理设计新型驱避分子奠定了理论基础。
关键词:酰基哌啶类化合物;昆虫驱避剂;气味结合蛋白;构效关系
“第十届全国新农药创制学术交流会”论文集
活性的关系,为新型酰基哌啶类化合物的结构改造提供理论依据。
2.材料与方法
2.1研究材料
中DEET-AgamOBPl晶体复合物(D:3N7H)[111。
2.2研究方法
采用Sybyl
化。分子对接参数附加起始构象值为1O,其它参数为默认值。
3.结果与讨论
成强烈的疏水相互作用。这些结果与Tsitsanou等‘儿1报道是一致的。
图。分子对接发现酰基哌啶类化合物与DEET类似,同样是其酰基氧通过Watl53与蛋白结合口袋中关
键残基Cys95或Gly92形成水桥作用,其疏水长链基团与蛋白中关键疏水残基形成范德华相互作用。可
见,酰基哌啶类化合物具有与DEET相似的OBPl结合模式,进一步说明这类化合物发挥驱避活性的潜
在靶标可能也是OBPI。
图l-酰基哌啶类化合物与AgamOBPl分子问相互作用模式图
(a)化合物5与AgamOBPl相互作用2D图(蓝色:氢键作用;绿色:范德华相互作用)
-205.
。第十届全国新农药创制学术交流会”论文集
3.1酰基哌啶类化合物中酰基端碳链的长度对化合物驱避活性的影响
化合物中哌啶环上引入取代基的大小和位置一致时,其打分随着它们酰基端碳链长度的增加而增大,这
主要是因为在AgamOBPl结合空腔中有一条狭长的疏水通道。可以与酰基哌啶类化合物中长碳链的疏
水基团产生疏水结合作用。随着化合物1,2,4酰基端碳链长度的增加,化合物与蛋白结合口袋的疏水
结合作用增强,导致相应化合物打分依次增高,含9个碳链长度的酰基哌啶类化合物的活性最高,这与
生测活性结果是一致的。与Groupl化合物对比发现,化合物5和9因含有10个碳原子表现出更高的打
分和驱避活性。但对于含11个碳链的化合物lo,n打分很高,其驱避活性反而降低了,分析原因可能
是由于含长碳链的酰基哌啶类化合物脂水分配系数较大,不容易进入生物体内,即使是相同浓度的化合
物施药给供试生物,也只有极少量能够到达靶标发挥药效。可见,酰基哌啶类化合物中当哌啶环上引入
取代基的大小和位置一定时,其酰基端碳链长度为9.10对化合物的驱避活性最有利。
表1具有驱避活性的酰基哌啶类化合物结构、对接打分以及活性数据
No. 结构式 Scol-cPT/d No. 结构式 ScorePT/d
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