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JmjC蛋白论文:OsJMJ714在水稻侧根发育中的功能分析
【中文摘要】组蛋白赖氨酸甲基化是一种重要的表观遗传学修饰,在调控基因表达过程中起重要作用。在动物中已经证明JmjC蛋白具有组蛋白去甲基化酶活性,并且JmjC结构域为这类蛋白的催化域。进化分析发现水稻中有20个含有JmjC结构域的蛋白,分为4个家族,其中JmjC domain only家族中的7个蛋白只含有JmjC结构域。研究报道水稻OsJMJ760影响组蛋白去甲基化,在花器官的形成与发育过程中具有重要作用,而其他成员的功能尚不清楚。OsJMJ714是JmjC domain only家族成员之一,其氨基酸序列的生物信息学分析结果表明OsJMJ714催化域的核心序列包含保守的Fe(II)和αKG结合位点;在此基础上,我们在水稻体内和体外组蛋白去甲基化实验中均证实OsJMJ714具有使组蛋白发生H3K9me1/2/3去甲基化修饰的组蛋白去甲基化酶活性。在转录水平上,我们通过荧光定量PCR分析了该基因在水稻苗期的表达特性。OsJMJ714基因在苗期不同组织的表达分析结果表明, OsJMJ714基因在根中的表达高于地上部的表达。我们发现OsJMJ714基因的表达受不同浓度NaCl处理的诱导;而且随着盐处理时间增长, OsJ...
【英文摘要】Histone lysine methylation is an important epigenetic modification and plays key roles in regulating gene expression. In animals, JmjC domain containing proteins have histone demethylase activity, and the JmjC domain is their essentil catalytic domain. In rice, at least 20 JmjC proteins have been identified and belong to four subfamilies. Among of these proteins, JmjC domain only family contains seven proteins with JmjC domains only. Except for OsJMJ760, the functions of the other members are unclear. In th...
【关键词】JmjC蛋白 组蛋白去甲基化修饰 水稻根系
【英文关键词】JmjC domain containing protein Histone demethylase Rice root
【索购全文】联系Q1:138113721 Q2:139938848
【目录】OsJMJ714在水稻侧根发育中的功能分析
摘要
6-7
ABSTRACT
7
缩略词表
11-12
第一章 引言
12-19
1.1 植物组蛋白甲基化研究进展
12-16
1.1.1 组蛋白修饰
12
1.1.2 植物中组蛋白甲基化与DNA 甲基化
12-13
1.1.3 植物中组蛋白去甲基化
13-14
1.1.4 含JmjC 结构域的蛋白与植物生长发育
14-16
1.2 水稻根的形成与发育
16-17
1.2.1 水稻根的类型
16
1.2.2 水稻初生根的模式
16-17
1.2.3 植物激素与根发育
17
1.3 根结构与盐胁迫
17-18
1.4 研究目的与意义
18-19
第二章 材料与方法
19-38
2.1 实验材料
19-22
2.1.1 植物材料
19
2.1.2 质粒载体及菌株
19
2.1.3 主要试剂
19-20
2.1.4 引物
20-22
2.1.5 培养基配制
22
2.2 实验方法
22-38
2.2.1 生物信息学分析
22
2.2.2 水稻材料的种植与培养
22
2.2.3 转基因水稻材料的创建与鉴定
22-23
2.2.4 转基因水稻根系表型分析实验
23
2.2.5 分子克隆
23-26
2.2.6 植物表达载体的构建
26-27
2.2.7 农杆菌电击感受态的制备
27
2.2.8 农杆菌电击转化
27
2.2.9 水稻总RNA 提取
27-28
2.2.10 cDNA 第一条链的合成
28-29
2.2.11 荧光定量PCR(Real-time PCR)反应体系及程序
29
2.2.12 CTAB 法提取水稻DNA
29-30
2.2.13 DNA 纯度与浓度检测
30
2.2.14 MSAP 检测方法
30-33
2.2.15 BL21 电击感受态制备
33
2.2.16 BL21 感受态细胞电击转化
33-34
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