基于QSPR研究绿原酸类化合物和血清白蛋白的结合.pdfVIP

No．4 2012第十四卷第四期*V01．14 摘 要：本文选取32个小分子化学成分和9个天然产物化学成分为训练集，利用Dragon软件计 述符，利用Linear 酸与血清蛋白的结合情况提供指导，为研究药物与血清蛋白的结合提供思路。‘ 关键词：分子描述符线性回归模型绿原酸血清白蛋白 doi：10．3969／j．issn．1674—3849．2012．04．005 原酸以半抗原形式存在，本身不具有致敏性，但它与 acid，CA)是由咖啡酸和奎 绿原酸(Chlorogenic 尼酸生成的缩酚酸，是植物细胞在有氧呼吸过程中 血清蛋白结合形成复合物能产生免疫原性，从而引 经莽草酸途径的中间产物合成的一种苯丙素类化合 起过敏反应[4】。所以研究绿原酸与血清蛋白的结合情 物，是一种具有重要生物活性的小分子物质，主要存 况对于其过敏反应的研究具有一定的指导意义。 在于金银花、栀子等药材中，具有广泛的药理作用， 血清蛋白是人体内含量最丰富的蛋白质，负责 如抗菌、抗病毒、保肝利胆、抗肿瘤、降血压、降血脂、 身体内各种内源与外源性物质的转运，对它们的分 清除自由基和兴奋中枢神经系统等，被认为是抗菌 布与沉淀有重要作用。当药物被吸收后，进入循环 解毒、消炎类中成药的主要有效成分，且通常被作为 系统，许多药物会与血清蛋白发生较强的、可逆的 定性定量的指标。但从20世纪60年代开始国内外结合，生成游离型和结合型的药物，通常游离型药 的专家学者就对绿原酸是否是致敏原存有争议，至 物具有药理活性，而结合型药物不能进行被动转运 今依然没有得出确切的研究结论”31。有研究表明绿 而失去其药理活性碡】。 Structure 定量结构一性质关系(QuantitiveProp— 收稿日期：2012—07—09 erty 修回日期：2012—08—13 ★ 息辨识研究，负责人：张燕玲。 -k★ mail：yjqiao@263．net。 一 and TraditionalChineseMedicineandMateria Science J7刀[World Technology／Modernizationof Medwa] 世界科学技术一中医药现代化★专题讨论：中药信息工程 的结构与性质的关系数学模型，并将之用于对模型 建模的准确率。因此本文采用标准化变换对所有描 外化合物的性质进行预测。QSPR方法用于药物代述符数据进行预处理，即对每个变量先减去样本平 谢、毒性、生物利用度、肠吸收等方面的研究已有成功 均值，再除以样本方差。 案例旧。本文建立药物与血清蛋白结合常数的QSPR， 为了使建模数据更加准确，本实验选用了We— 用来预测绿原酸类化合物与血清蛋白的结合。 ka3．6．0机器学习平台中的CfsSubsetEvalr131评价方法 一、材料和方法 希望找到能区分所有样本的最佳描述符组合。 1．挝—盘 二、结果与讨论 version2．1 分子描述符利用Dragonprofession