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科衰雀赢 医l药J与I保I健 癌症相关点突变的特征分析 蔡榕榕·刘妍z (1、辽宁师范大学生命科学学院，辽宁大连1160292、沈阳市第二中学，辽宁沈阳110016) 摘要；点突变是导致癌症突变中最常见的类型。那么。癌症相关点突变是否存在某些共有的特征，或者它们在基因编码区的分布是否有某些 特异性?到目前为止，仍不是十分清晰。这里利用生物信息学方法对99个基因中1227个癌症相关点突变进行了分析，以期发现它们的特征。结果 显示超过60％的癌症相关点突变位于外显子剪接增强子内(EsE)。 关键词：点突变；癌症；外显子剪接增强子 前言 个基因中，点突变的数目从l到337个不等。ESE预测软件可以用来研究突变诱导外显子跳 目前对癌症基因的研究，主要围绕着癌症 其中，含有点突变数日最多的基阂是BRCAI 基因中点突变与肿瘤发生之间的关系。所以。 和BRCA2，两者都足乳腺癌基因。 酶?基因中大于50％突变都与非正常剪接相关。 我们对癌症相关点突变进行研究，能够为深入 2．2佗于ESE中的点突变 研究癌症的生物学特征提供一定的依据。 我们发现60．31％(740／1227)癌症相关之间也存往的紧密相关性。所以，这里研究结 关r组成性剪接和选择性剪接的研究表 点突变位于88个基冈中的1172个ESE基序果与之前的这些报道是相一致的。另外。这里 明，事实上，当点突变位于具有功能的ESE内(其余11个基因中的点突变并不位于ESE研究认为癌症相关点突变导致了SR蛋内与 基序内时，突变的致病作用是与剪接相荚的。 基序内)。在88个基岗中，80．49％(231／287)ESE非正确结合从Ifii使剪接扰乱，这日I能是癌 ESE是一种基本的剪接岗子能够与sR蛋[j家 的突变外显予含有位于ESE基序内的突变，症的主要致病方式之一。 族结合。研究表明，位于ESE基序内的点突表明位于ESE基序内的突变很可能与疾病相 参考文献 变可以导致SR蛋白不能正确的结合ESE，从关。 『II周助人，孙开来．肿瘤细胞中基因选择性剪接 而使剪接复合体小能识别该ESE所在的外显 ESE种类f根据结合SR蛋白分类)在表 子而导致外显子跳跃。阂此，位于ESE基序l中列出。结果显示，ESE被4种类型的剪接177—281． 内的点突变不仅町以改变mRNA序列和蛋白 Y，WaughA，eta1．Dis— 因子SC35，SF2／ASF，SRp40和SRp55蛋白识【2]KaminkerJS，Zhang 序列的组成而且Ⅱ，以扰乱剪接。 别的比率分别为27％，27％，28％和18％，如 Cancer-AssociatedMissenseMuta- tinguishing 为了探究癌症相关点突变的特征，现从人 tionsfromCommon 表l所示，被SRp55剪接因子识别的ESE数 Res， 类基因突变数据(HGMD)中凋取了1227个目明硅少丁其它3种剪接因子，并且4种类型2007，2：456--473． 癌症相关点突变。并对其进行了较系统的特征 剪接因子的平均得分都高于3．0。 L，Krainer of鞠 【3]Cartegni AR．DismptiOn 分析。 表lESE基序 ex