猴面花 miRNA 及靶基因的生物信息学预测.pdfVIP

贵州农业科学 ， （）： 　 　 ２０１５ ４３ １ ８ ～１２ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ａ ｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ 　 ｇ ［文章编号］ （ ） １００１３６０１ ２０１５ ０１０００２０００８０５ 猴面花ｍｉＲＮＡ 及靶基因的生物信息学预测 ， ， ， １ ２ ３ ２ ２ ２ １ ２ 李崇奇 ，沈文涛 ，言 普 ，黎小瑛 ，周 鹏 （ 海南大学农学院，海南海口 ； 中国热带农业科学院热带生物技术研究所分析测试中心， １． ５７０２２８ ２． 海南海口 ； 海南医学院生物化学与分子生物学教研室，海南海口 ） ５７１１０１ ３． ５７１１９９ ［摘 要］以猴面花基因组序列为试材，通过 ｓＲｏｂｏｔ 网站进行茎环结构预测，应用ｂｌａｓｔ２．２．２７＋软件 　 　 　 ｐ 与ｒｆａｍ 数据库和 ｐｆａｍ 数据库比对后去除非 ｍｉＲＮＡ 序列，应用 ｂｉｏｅｄｉｔ 分析 ｍｉＲＮＡ 序列及前体序列的碱 基组成特点。结果表明：猴面花基因组中共发现 条成熟 序列，分别属于 个不同 家 １０５ ｍｉＲＮＡ ４９ ｍｉＲＮＡ 族； 序列和其侧翼序列都存在碱基偏倚现象， 端第 碱基和第 碱基尿嘧啶和胞嘧啶出 ｍｉＲＮＡ ｍｉＲＮＡ５′ １ １９ 现的频率分别为 和 ； 个 预测到了靶基因，其中有 个靶向转录因子。 ６７．６％ ４９．５％ ９３ ｍｉＲＮＡ ６４ ［关键词］猴面花； ；基因组序列；转录因子 ｍｉＲＮＡ ［中图分类号］ ［文献标识码］ Ｑ７４ Ａ Ｂ ｉ ｏｉ ｎｆｏｒｍａｔｉ ｃ Ｐｒｅｄｉ ｃｔｉ ｏｎ ｏｆ ｍｉ ｃｒｏＲＮＡ ａｎｄ Ｔｈｅｉ ｒ Ｔａｒｇｅｔ Ｇｅｎｅ ｉ ｎ Ｍｉ ｍｕｌ ｕｓ ｇｕｔａｔｕｓ ， ， ， １ ２ ３ ２ ２ ２ １ ２  ＬＩ Ｃｈｏｎ ｉ ，