解码基因组中的“暗物质”.pdfVIP

第 32卷第 1期 同济 大学 学 报 (医学版 ) V01．32No．1 2011年 2月 JOURNALOFTONG~UNIVERSITY(MEDICALSCIENCE) Feb．．2011 doi：10．3969／j．issnl008—0392．2011．01．001 · 专家笔谈 · 解码基因组中的 “暗物质 孙奋勇 (同济大学附属第十人民医院检验科 ，上海 200072) 【关键词】长链非编码RNA；功能；microRNA；疾病；诊断；治疗 ． 【中图分类号】R34 【文献标志码】A 【文章编号】1008—0392(2011)01—0001—04 长链非编码RNA(1ongnoncodingRNA，lncRNA) 案：(1)高度复杂的生命形式往往具有更加大量的 是非编码RNA家族的重要成员，因其数量、种类、功能 非编码转录本数量；(2)在哺乳动物基因组 中， 状况都不明确，又被称作基因组中的 “暗物质”。本研 mRNA只占全部转录本的2％，剩余98％是非编码 RNA J 究对其研究价值、作用的分子机制、与疾病的关系进行 。 这些转录本很可能在细胞生命活动的各 了探讨，重点分析了lncRNAs与非编码RNA家族另一 个环节中承担了极其重要的作用。因此，必须重新 重要成员microRNA的相互关系，提出了lncRNAs调 思考非编码 RNA在细胞中的作用。 控microRNA功能的新假说。目前，关于 lncRNA的研 1 lncRNAs的潜在作用 究才刚刚起步，相信不久的将来 lncRNA会成为分子生 物研究领域又一颗璀璨的明星。 新一代测序技术的结果表明，基因组具有密集 20世纪物理学界最重要的发现之一，可能就是 转录的特点，其中80％的转录本为长链非编码RNA 暗物质了，这种难 以观察的物质以极大的权重裹挟 (1ongnoncodingRNA，lncRNAs) 。长期以来，这 着熟知的 “明物质”的世界，动摇着关于物质世界的 些 lncRNAs被误认为是转录的 “噪声”，但有4点证 基本认知与规律。21世纪初，生命科学领域中最伟 据表明这些转录本可能直接参与了细胞功能的调 大的发现毫无疑问是另一种形式的 “暗物质”：非编 控：(1)lncRNAs通常较长(一般大于2kb，甚至超 码 RNA。之所以称为 “暗物质”，是因为其数量，种 过 100kb)，具有 mRNA样结构，经过剪接 ，具有 类与功能均不明确，尚缺乏有效的研究手段，然而正 polyA尾巴与启动子结构，分化过程中有动态的表 是这些 “暗物质”，却蕴藏着调控细胞功能的巨大 达与不同的剪接方式；(2)lncRNAs启动子同样可 潜力。 以结合转录因子，如 0ct3／4，Nanog，CREB，Spl， 过去 10年中，基因组测序获得的数据达到空前 c—myc，Sox2与p53_4]，局部染色质组蛋白同样具有 规模，让我们对基因组有了更加深刻的认识。但与 特征性 的修饰方式与结构特征；(3)大多数的 所期待的结果大相径庭，人、小鼠与线虫的蛋 白编码 lncRNAs在组织分化发育过程 中，都具有 明显的时 基因数量并没有太大的差异，有些低级的多细胞生 空表达特异性，如有人针对小 鼠的1300个 lncRNAs 命的编码基因数量甚至少于单细胞生命个体 ¨