CCl4诱导的小鼠纤维化肝组织微小RNA差异表达谱及初步功能分析.pdfVIP

中国病理生理杂志 ChineseJournalofPathophysiology 2013，29(12)：2201-2211 [文章编号] 1000-4718(2013)12-2201-11 CCI4诱导的小鼠纤维化肝组织微小 RNA 差异表达谱及初步功能分析 王清兰 ， 李俊霞 ， 吕 靖 ， 陶艳艳 ， 闺秀川 ， 刘成海 ，， (上海中医药大学附属曙光医院肝病研究所，上海市中医临床重点实验室， 上海中医药大学肝肾疾病病证教育部重点实验室，上海高校中医内科学E研究院，上海201203) [摘 要] 目的：应用微小 RNA(miRNA)芯片技术研究miRNAs在四氯化碳 (CC1)诱导的小 鼠纤维化肝脏 中的差异表达谱，并基于基因本体论(geneontology，Go)分析及信号转导通路分析发现差异miRNAs的主要功能。 方法：实验分为正常组及模型组，皮下注射 CC1复制小鼠肝纤维化模型；应用 Agilent小 鼠miRNA寡核苷酸基因 芯片检测各组肝脏miRNA表达谱。用随机方差模型t检验筛选2组问的差异 miRNAs，并预测其靶基因。对靶基 因进行 GO分析及信号转导通路分析发现差异miRNAs发挥的主要功能。结果：正常组与模型组间共筛选出39个 差异 miRNAs，其中模型组较正常组上调的23个，下调的16个。GO分析及信号转导通路分析结果提示差异 miR． NAs可能调控的靶基因及其参与的生物学功能包括细胞的增殖与活化 、细胞凋亡、细胞周辫、细胞黏附、细胞迁移、 炎症反应 、转化生长因子B(TGF-31)／Smads信号转导通路、Wnt受体信号转导通路、蛋 白代谢过程的调控等。GO 分析发现关键的上调 miRNA包括 mmu—miR一322、mmu．miR．15b、mmu．miR．195、mmu．miR-200b、mmu．miR-214等，关 键的下调 miRNA包括 mmu—miR一16、mmu-miR一130a、mmu—miR一101b、mmu—miR一30a和 mmu-miR．30e等。对显著性 GO与显著性信号通路所属的靶基因取交集 ，对网络中miRNA在网络中的调控地位进行评价，结果发现关键的上 调 miRNAs包括mmu-miR-200b、mmu-miR-322、mmu-miR-106b、mmu-miR-23a、mmu-miR-15b等，关键的下调miRNAs 包括 mmu-miR-16、mmu—miR-30e、mmu-miR一30c、mmu-miR-30a、mmu-miR-130a等。结论：纤维化肝组织 miRNAs表 达较正常肝组织发生明显变化；肝纤维化形成的各个环节，包括细胞的增殖与活化、细胞黏附、细胞凋亡、细胞迁移 与分化、物质代谢、TGF-B信号通路等都可能受 miRNAs的调控。 [关键词] 微小 RNA；肝纤维化；差异表达；四氯化碳 [中图分类号] R363．2 [文献标志码] A doi：10．3969／j．issn．1000．4718．2013．12．014 FunctionalanalysisofdifferentialmicroRNA expressionprofileinmouse fibroticlivertissuesinducedbyCCI WANGQing．1an ，LIJun．xia， Jing，‘TAOYan．yan，YANXiu—chuan，LIUCheng． hai，，。， (InstituteofLiverDiseases，ShuguangHospitalAffiliatedtoShanghaiUniversityof TraditionalChineseMedicine， ShanghaiClincialKeyLaboratoryofTraditionalChineseMedicine，KeyLaboratoryofLiverandKidneyDsieases，Minsitry ofEducatoin，ShanghaiUnive~i@ofTraditionalChineseMedciine，E—InstituteofTCMInternalMedciine，ShanghaiMu— n