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基于PCR-DGGE四川中江丹参轮作期间土壤真菌遗传多样性变化特征研究.pdfVIP

基于PCR-DGGE四川中江丹参轮作期间土壤真菌遗传多样性变化特征研究.pdf

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基于PCR-DGGE四川中江丹参轮作期间土壤真菌遗传多样性变化特征研究.pdf

中国虐学c亟攉 2013,29(23):153—157 ChineseAgriculturalScienceBulletin 基于PCR—DGGE四川中江丹参轮作期间 土壤真菌遗传多样性变化特征研究 林贵兵 ,万德光 ,严铸云 ,王 海 ,叶丽琴。,何冬梅 (江西中医学院,南昌330004;成都中医药大学,中药材标准化教育部重点实验室,成都610075; 江西财经大学,南昌330013) 摘 要:旨在研究四川中江丹参轮作期间土壤真菌遗传 多样性变化特征。分离提取土壤微生物DNA, PCR特异扩增,以DGGE分离扩增片段并测序,在GenBank中查得茵种。结果表明:中江丹参轮作期 间 ,土壤真 菌群 落 包括 :Termitadasp.YAKU2,Agaricusbisporus,Cer~ozoan,Cordyceps,Geomyces desnuctans,Geomycessp.P7,Cordycepsbrongniartii,Penicillimnsp.KCTC6774,unculturedIodophanus cloneS.54。聚类分析表明,休地 1年与正茬丹参的土壤真茵群落结构相似,而与休地3、4年的土壤真菌 群落有明显差异;休地2年是属于过渡状态。研究认为中江丹参轮作期间,土壤真菌群落遗传多样性结 构逐渐恢复;而且休地的第2年是土壤真菌群落结构恢复的关键时期,与前期报告结论一致。 关键词:丹参土壤真菌;PCR.DGGE;遗传多样性;变化特征 中图分类号:R932 文献标志码:A 论文编号:2012.3675 ResearchonCharacteristiesofGeneticDiversityVariationofSoilFungiBasedonPCR—DGGE DuringCroppingRotationPeriodofSMviaeMiltiorrtuzaeinZhongjiang,SiehuanProvince LinGuibing ,W anDeguang2,YanZhuyun,W angHai,YeLiqin,HeDongmei (JiangxiUniversityofTCM,Nanchang330004; ChengduUnivemityofTCM,Chengdu610075; 3jiangxiUnive~ityofFinanceandEconomics,Nanchang330013) Abstract:Inthispaper,theaimsweretostudygeneticdiversityvariationcharacteristicsofsoilfungalduring SalviaMiltiorrhizaBge.croppingrotationperiodinZhongjiangCountyofSichuanProvince.Soilmicrobial DNAwasisolatedandextracted;thenspecificDNAfragmentsoffungiwereamplifiedbyPCR;theamplifying DNAfragmentswereseparatedbyDGGE.ThestrainsweregainedinGenBankbyDNA sequencing.Theresuh showedthatduringtheSalviaMihiorrhizaBge.croppingrotationperiodinZhongjiangCounty,soilfungal communityincluded:Termitariasp.YAKU2,Agaricusbisporus,cercozoan,Cordyceps,Geomycesdestructans, Geomycessp.P7,Cordycepsbrongniartii,Penicillium s

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