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基于PCR-DGGE四川中江丹参轮作期间土壤真菌遗传多样性变化特征研究.pdf
中国虐学c亟攉 2013,29(23):153—157
ChineseAgriculturalScienceBulletin
基于PCR—DGGE四川中江丹参轮作期间
土壤真菌遗传多样性变化特征研究
林贵兵 ,万德光 ,严铸云 ,王 海 ,叶丽琴。,何冬梅
(江西中医学院,南昌330004;成都中医药大学,中药材标准化教育部重点实验室,成都610075;
江西财经大学,南昌330013)
摘 要:旨在研究四川中江丹参轮作期间土壤真菌遗传 多样性变化特征。分离提取土壤微生物DNA,
PCR特异扩增,以DGGE分离扩增片段并测序,在GenBank中查得茵种。结果表明:中江丹参轮作期
间 ,土壤真 菌群 落 包括 :Termitadasp.YAKU2,Agaricusbisporus,Cer~ozoan,Cordyceps,Geomyces
desnuctans,Geomycessp.P7,Cordycepsbrongniartii,Penicillimnsp.KCTC6774,unculturedIodophanus
cloneS.54。聚类分析表明,休地 1年与正茬丹参的土壤真茵群落结构相似,而与休地3、4年的土壤真菌
群落有明显差异;休地2年是属于过渡状态。研究认为中江丹参轮作期间,土壤真菌群落遗传多样性结
构逐渐恢复;而且休地的第2年是土壤真菌群落结构恢复的关键时期,与前期报告结论一致。
关键词:丹参土壤真菌;PCR.DGGE;遗传多样性;变化特征
中图分类号:R932 文献标志码:A 论文编号:2012.3675
ResearchonCharacteristiesofGeneticDiversityVariationofSoilFungiBasedonPCR—DGGE
DuringCroppingRotationPeriodofSMviaeMiltiorrtuzaeinZhongjiang,SiehuanProvince
LinGuibing ,W anDeguang2,YanZhuyun,W angHai,YeLiqin,HeDongmei
(JiangxiUniversityofTCM,Nanchang330004;
ChengduUnivemityofTCM,Chengdu610075;
3jiangxiUnive~ityofFinanceandEconomics,Nanchang330013)
Abstract:Inthispaper,theaimsweretostudygeneticdiversityvariationcharacteristicsofsoilfungalduring
SalviaMiltiorrhizaBge.croppingrotationperiodinZhongjiangCountyofSichuanProvince.Soilmicrobial
DNAwasisolatedandextracted;thenspecificDNAfragmentsoffungiwereamplifiedbyPCR;theamplifying
DNAfragmentswereseparatedbyDGGE.ThestrainsweregainedinGenBankbyDNA sequencing.Theresuh
showedthatduringtheSalviaMihiorrhizaBge.croppingrotationperiodinZhongjiangCounty,soilfungal
communityincluded:Termitariasp.YAKU2,Agaricusbisporus,cercozoan,Cordyceps,Geomycesdestructans,
Geomycessp.P7,Cordycepsbrongniartii,Penicillium s
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