湖南沙子岭猪SLA-DR基因克隆和生物信息学分析.pdfVIP

湖南沙子岭猪SLA-DR基因克隆和生物信息学分析.pdf

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HEREDITAS (Beijing) 2007 12 , 29(12): 1491―1496 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.1360/yc-007-1491 SLA−DR 1 1 2 2 1 唐医亚 , 邢晓为 , 薛立群 , 黄生强 , 王维 1. , 410013; 2. , 410128 : 为了克隆湖南沙子岭猪SLA-DRA 和SLA-DRB 基因, 分析SLA 基因特性和抗原多态性, 评价湖南沙子岭 猪在异种移植中的应用前景奠定基础。应用RT-PCR 分别扩增湖南沙子岭猪SLA-DRA 和SLA-DRB 基因, 鉴定 后克隆到PUCm-T 载体并进行测序, 用NCBI 中的BLAST 和ExPASY 中相关软件进行生物信息学分析。得到 的湖南沙子岭猪SLA-DRA 和SLA-DRB 基因特异性基因片段, 大小分别为 1 177 bp 和909 bp 。生物信息学分析 发现, 所扩增的SLA-DRA 和SLA-DRB 基因片段均包含完整的开放阅读框, 分别编码252 和266 个氨基酸残基。 将湖南沙子岭猪SLA-DRA 和SLA-DRB 基因在 GenBank 登录, 登录号分别为EF143987 和EF143988 。同源性 分析发现, 湖南沙子岭猪SLA-DRA 和SLA-DRB 与人类相应的DRA 、DRB 相比, 核苷酸序列同源性分别为83% 和83 %, 编码氨基酸同源性分别为83% 和79% 。与GenBank 登录的其他猪种相比, SLA-DRA 基因同源性最高 可达 100 %, 而SLA-DRB 基因具有多态性。 : 猪白细胞抗原; 沙子岭猪; 基因克隆; 异种移植 Cloning and bioinformatics analysis of SLA−DR genes in Hunan Shaziling pigs 1 1 2 2 1 TANG Yi-Ya , XING Xiao-Wei , XUE Li-Qun , HUANG Sheng-Qiang , WANG Wei 1. Cell Transplantation Gene Therapy Center, The third Xiangya Hospital of Central South University, Changsha 410013, China; 2. Department of Animal Science and Technology, Hunan Agricultural University, Changsha 410128, China Abstract: In order to clone class II DRA and DRB genes of swine leukocyte antigen (SLA) in Hunan Shaziling pigs, to analyze their characteristics and polymorphism and to provide immunological basic parameters for xenotransplantation from pigs

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