5种克罗诺杆菌鞭毛蛋白fliC基因的克隆和序列分析.pdfVIP

第 33卷第 1期 江苏师范大学学报 (自然科学版) V01．33。NO．1 2015年 2月 JournalofJiangsuNormalUniversity(NaturalScienceEdition) Feb．，2O15 文章编号 ：2095—4298(2015)01—0080-04 5种克罗诺杆菌鞭毛蛋白fliC基 因的 克隆和序列分析 姜 华，徐 湾，张逸飞，邹小倩，裴尚飞，赵珉生，李远宏 (徐州医学 院 公共卫生学院，江苏 徐州 221004) 摘要 ：根据 C．sakazakiiBAA894全基 因组序列 中fliC基因(GeneID：CP000783．1)，设计特异性引物 ，通过 PCR 方法扩增 了5种克罗诺杆菌 fliC基 因的全长序列，并通过生物信息学方法对 fliC基 因进行 了序列分析．序列分析 结果表 明：fliC基 因的全长为 837bp，编码 279个氨基酸．同源性分析表 明：5种克罗诺杆菌 fliC基 因的序列相似 性为 92．11 ～99．4O ；与其它细菌的fliC序列进行 比较 ，其核酸序列 同源性为 51．73 ～82．57 ．这表 明克罗 诺杆菌 C基 因具有较高的保守性，可作为制备克罗诺杆菌多克隆抗体或单克隆抗体的一种候选抗原． 关键词 ：克罗诺杆菌 ；鞭毛蛋 白fliC基 因；序列分析 中图分类号 ：R378 文献标识码 ：A doi：10．3969／j．issn．2095—4298．2O15．O1．015 CloningandsequenceanalysisofflagellingenefliC from fiveCronobacterspecies JiangHua，XuWan，ZhangYifei，ZouXiaoqian，PeiShangfei，ZhaoMinsheng，LiYuanhong (SchoolofPublicHealth，XuzhouMedicalCollege，Xuzhou221004，Jiangsu，China) Abstract：ToinvestigatethepossibilityoffziCasacandidateantigenforantibodyproduction，primerswerede— signedbasedonthegenomesequenceofC．sakazakiiBAA一894(GeneID：CP000783．1)publishedinGenBank．The flagellargenefliCfrom fiveCronobacterspecieswasamplifiedbyPCR．SequenceanalysisrevealedthatfliCgene fragmentis837bplongandencodesaputativeproteinof279aminoacids．BlastsearchesbasedonfliC genese— quencesshowedhighsequenceidentity(92．11 ～ 99．40 )withinthefiveCronobacterspecies，andrelativelow se— quenceidentity(51．73 ～ 82．57 )withotherbacteriathatcanbedownloadfrom GenBank．Theresultsindicated thatfliCisahighlyconservedproteinwithinthegenusCronobacter，whichmightbeacandidateantigenforthepro— ductionofCronobacterpolyclonalandmonoclonalantibody． Keywords：Cronobacterspp．；flagellingenefliC；seque