生物医学文献的知识发现与数据整合.pdfVIP

中华医学图书情报杂志2015年2月 第 24卷第 2期 ChinJMedLibrInfSci，Vo1．24No．2 February，2015 ·15 · DOI：10．3969／j．issn．1671-3982．2015．02．004 · 研究与探讨 · 生物 医学文献的知识发现与数据整合 康宏宇，李 姣 [摘要]通过整合生物医学文献与科学数据，创建数据和文献能够交互操作的开放式环境，充分发现生命科学领域新的知识， 已经成为当前数据密集型科学发现的研究热点之一。系统分析和阐述了国内外生物 医学文献挖掘与科学数据整合领域的整 合方式和研究内容，调研了不同整合方式的对应系统，展望了生物医学文献与科学数据整合领域的发展趋势。 [关键词]生物医学；文献挖掘；科学数据；数据整合 [中图分类号]G250．74；G254．9；R-058 [文献标志码]A [文章编号]1671—3982(2015)02—0015—06 Knowledgediscoveryanddataintegrationinbiomedicalliterature KANG Hong-yu，LIJiao (MedicalInformationInstitute，ChineseAcademyofMedicalSciences，Beijing100020，China) Correspondingauthor：LIJiao [Abstract]Sinceitisoneofthehotspotstodiscoverthenewknowledgeinlifescienceindata-intensivescientific discoverybyintegratingthebiomedicalliteratureandscientificdatathatcanprovideanopenenvironmentfortheir interactiveoperation，theminingofforeignanddomesticbiomedicalliteratureandintegrationofscientificdatawere analyzed，thecorrespondingsystemsfordifferentintegrationmethodswereinvestigated，thedevelopmenttrend in biomedicalliteratureandscientificdataintergationwaspredicted． [Keywords]Biomedicine；Literaturemining；Scientificdata；Dataintergation 科学数据与文献是科技创新链条中紧密相关、 密集型科学研究第四范式呼之欲出 J。 使用紧密结合的重要 内容，实现两者的互操作对于 2009年微软研究院出版的 《第 四范式：数据密 科学研究具有重要的意义…。人类科学研究又一 集型科学发现》(TheFouahParadigm：Data—intensive 次面临范式的转变，e—Science环境已现端倪 ，数据 ScientificDiscovery) 提出了 “基于数据密集型计 算的科学研究第四范式”。吉姆 -格雷 (JimGray) [基金项 目】国家科技图书文献中心 “NSTL网络服务系统整合PMC 在关于科学研究第四范式的著名演讲中也讨论了即 全文系统方案研究”和中央级公益性科研院所基本科研 将到来的学术交流革命，认为互联网能把所有科学 业务费项 目“医学信息学理论方法在转化医学研究中的 数据与文献联系在一起，创建一个数据和文献能够 应用”(13R0101)研究成果之一。 交互操作的世界，以提高科学的 “信息速率”，促进 [作者单位]中国医学科学院医学信息研究所，北京 100020 研究人员的科学生产力。 [作者简介]康宏宇(1988一)，女，河北张家 口人，硕士，