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Mascot检索软件在蛋白 质质谱鉴定中的应用 目录  生物质谱简介  Mascot简介  应用实例 生物质谱简介 ——基本结构 质量分析器 离子源(ion 检测器 (mass analyzer) ： source)：使蛋 (detecter)： 将离子源中形成 白或多肽变成 实现离子信 的离子按质荷比 带电离子 号检测 大小分开 常见类型： 常见类型： 常见类型： A: 电喷雾电离(ESI) A: 四级杆(Quadrupole) A:直接检测器 B:基质辅助激光 B:离子阱(Ion trap) B: 电子倍增器 解吸电离(MALDI) C:飞行时间(TOF) C: 闪烁检测器 生物质谱简介 ——基本类型  MALDI-TOF 以及MALDI-TOF/TOF:  质谱类型：TOF质谱仪  样品状态：固态  优点：仪器结构简单，扫描速度快，高通量  缺点：结果可靠性依赖于样品质量  LC-ESI-MS/MS:  质谱类型：三级四级杆、离子阱、Q-TOF  样品状态：液态  优点：灵敏度高，结果更可靠  缺点：低通量、价格贵 生物质谱简介 ——主要品牌  美国应用生物系统(ABI) ：美国  安捷伦科技(Agilent)：美国  布鲁克-道尔顿(Bruker Daltonics)：美国  戴安公司(Dionex)：美国  岛津(Shimadzu)：日本  赛默飞世科技(Thermo Fisher)：美国(原美国热电)  沃特世科技(Waters)：美国 生物质谱简介 ——蛋白质质谱鉴定基本流程 二级质谱 肽段混合物 一级质谱 二级碎片 肽段分 分子量 子量 蛋白 搜索软件 DNA/protein数据库 鉴定结果 生物质谱简介 ——蛋白质质谱检索常用软件 软件名称 Mascot SEQUEST X!Tandem 软件类型 商业软件 商业软件 免费开源软件 数据格式 MGF 、DTA RAW 、DTA