系统发生分析程序MrBayes3_1使用方法介绍.pdfVIP

安徽农业科学 , Journal of Anhu i A gri. Sci. 2009 , 37 ( 33) : 16665 - 16669 责任编辑 　王淼 　责任校对 　况玲玲 系统发生分析程序 M rBayes 3 . 1使用方法介绍 1 2 2 ( ) 王 勇 ,陈克平 ,姚 勤 　 1. 江苏大学食品与生物工程学院 ,江苏镇江 2 120 13; 2. 江苏大学生命科学研究院 ,江苏镇江 2 120 13 摘要　在介绍 M rB ayes 3. 1程序基本特点以及 N exu s文件准备的基础上 ,选取普通 DNA 序列、普通蛋白质序列、含编码区域的 DNA 序 列、mRNA 序列以及混合型数据文件为例分别介绍了M rB ayes 3. 1程序的基本使用方法 ,为初学者正确使用该程序提供了操作指南 , 同 时为深入学习与掌握该程序的特殊用途打好基础 。 关键词　系统发生分析;贝叶斯推理法;M rB ayes 3. 1;使用方法 ( ) 中图分类号　TP 311　　文献标识码　A　　文章编号　0517 - 6611 2009 33 - 16665 - 05 An In troduction to the O pera tion M ethod of Phy logenetic Ana ly sis Program M rBayes 3. 1 ( ) W A NG Y ong et a l　 School of Food and B iological Engineering, J iangsu Un iversity, Zhenj iang, J iangsu 2 120 13 A b stract　A fter giving a brief introduction to the characteristic s ofM rB aye s 3. 1 p rogram and the p rep aration of N exu s files, the ba sic op erat ing m ethod s of M rB aye s 3. 1 p rogram were introduced by tak ing common DNA sequence s, common p rotein sequence s, DNA sequence s w ith coding region s, mRNA sequence s and m ixed data file as examp le s. Th is article p rovided an op erating gu idance for p rim ary u sers to run the p rogram correctly. M eanwh ile, it con stitu ted the necessary p rep aratory op eration s for further study and m a stery of sp ecific app lication s of the p rogram. Key words　Phylogenetic analysis; B aye sian inference; M rB aye s 3. 1; Op erating m ethod ( ) 　　近年来 ,系统发生分析 phylogenetic analysis 在探讨不