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微过氧化物酶水溶液的ABEEMMM动力学模拟.pdf
HuaxueXuebao)
物理化学学报(Wuli
June Acta 1035
P细j．一Chim．Sin．，2008，24(6)：1035-1040
【Article】
微过氧化物酶水溶液的ABEEM／MM动力学模拟
崔宝秋1’2 宫利东·，+ 赵东霞，
(1辽宁师范大学化学化工学院，辽宁大连116029；2锦州师范高等专科学校化学系，辽宁锦州121000)
摘要：应用原子一键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM／MM)，对微过氧化物酶水溶液进行了分子动力学模
拟．研究了水溶液对微过氧化物酶的结构，血红素的皱裂构象以及轴配体咪哗基的取向的影响．结果表明，在水
溶液中微过氧化物酶的骨架氨基酸是稳定的，而血红素的皱裂构象在水分子的作用下趋于平面．与血红素轴配
体咪唑基键连的组氨酸决定着咪唑基的空间取向，而咪唑基与血红素侧链的丙酸基的静电作用对其取向仅起次
要作用．
关键词：ABEEM／MM浮动电荷分子力场；微过氧化物酶；血红索；构象；分子动力学模拟
中图分类号：0642；0643
MolecularSimulationof in Solution
Dynamics MicroperoxidaseAqueous
in ABEEM／MMMethod
Termsofthe
CUI GONG ZHAO
Bao—Qiu也 Li—Don91’ Dong—Xial
andChemical Normal Province，P．R．China；
(1CollegeofChemistry Engineering，LiaoningUniversity，Dalian116029，Liaoning
Teacher Province，尸．尼China)
2DepartmentofChemist侈,JinzhouCollege，Jinzhou121000,Liaoning
Abstract：In molecular
termsoftheatom-bond mechanics(ABEEM／
electronegativityequilizationfluctuatingcharge
simulationon ofwatermolecules
MM)，molecular aqueous performed．Theimpact
dynamics microperoxidases(MP)was
onthestructureof conformationofthe theorientationofthe imidazolewere
MP，themffiing heme，and axiallyligated
aminoacidsof MPare the
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