拟南芥和水稻锚蛋白（ANKP）基因家族初步研究.pdfVIP

摘 要 锚蛋白是一类十分重要的结联蛋白家族，其结构的主要特征是含 有数量不一的锚定重复序列模体，主要作用是介导蛋白质与蛋白质 的相互作用，广泛参与细胞生命活动的调节。本论文在拟南芥和水稻 基因组测序工作完成的基础上，利用生物信息学的方法，鉴定和分析 了两种模式植物基因组的锚定蛋白基因。研究结果如下： 1．鉴定得到108个拟南芥基因组锚定蛋白基因，并根据蛋白质 二级结构分析，将它们进行聚类分析，共分成3个大组10个小组。 拟南芥基因芯片数据库的查询和分析，得到一些植物特有的锚定蛋白 基因，主要表现在对植物病原体、逆境、光节律以及蛋白质合成等方 面，但它们的功能需要实验进一步确定。 2．基于基因芯片的分析结果，选择lO个拟抗病相关基因，在转 录水平上初步研究了拟南芥拟抗性基因受植物病原体诱导后的表达 情况，发现Atlgl0340对镰刀菌(Fusariumoxysporum)敏感，在其侵染 后的第2天出现表达高峰。 3．克隆和初步分析了拟南芥基因Atl910340，基因表达模式分析 表明Atl 910340在除角果外均有表达，亚细胞定位分析发现 Atl910340定位于质膜上。 4．鉴定得到142个水稻基因组锚蛋白基因，并根据蛋白质二级 结构分析，将它们进行聚类分析，共分成3个大组14个小组。并用 RT．PCR的方法分析了水稻锚定膜蛋白基因ANKTM的表达模式。 5．比较和分析了拟南芥和水稻基因组的锚蛋白基因。首先，跟 动物或其它生物比较，有些锚蛋白基因在各生物体比较保守，这些保 守基因可能存在于所有生物中，作为细胞生活的基本组成部分。其次， 两种模式植物的锚蛋白基因比较表明，它们在基因组水平存在一定程 度的相似性，可能代表着植物所共有的生理功能。同时，两者之间也 存在一定的差异，这些植物锚蛋白分子可能是单子叶或双子叶植物特 有的，或者为适应陆生或水生等不同的生活环境而不断进化发展而形 成的。 关键词：拟南芥，水稻， 锚定重复序列，表达模式 Ⅱ ABSTRACT ANK isan memberofthe proteinimportant bindingproteinfamily， which in motif,mediated containingankyrinrepeats protein—protein inthe ofdiversecellular involved activity． recognition，may regulation Basedon of and Arabidopsisrice，thispaper genomesequencing ANK twomodel the identifiedand the of analyzed genes plantsusing resultsasfollows： methodesofbioinformatics．The havebeen are108ANK of which 1．There