猪地全基因组水平SNP研究现状陈慧勇.pdfVIP

猪地全基因组水平SNP研究现状陈慧勇.pdf

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第23卷第4期 生命科学 Vol. 23, No. 4 2011年4月 Chinese Bulletin of Life Sciences Apr., 2011 文章编号:1004-0374(2011)04-0390-04 SNP 猪的全基因组水平 研究现状 1 1 2 * 陈慧勇,罗赛群,吴珍芳 (1 中南大学生物科学与技术学院分子生物学研究中心,长沙 410078 ;2 华南农业大学动物科技系,广州 510640) SNP single nucleotide polymorphism 摘 要: ( ,单核苷酸多态) 在猪基因组中的分布极其广泛,平均分布间 300~400 bp 55 隔为 ,相关数据库收录已达 万条。猪基因组测序已取得实质性进展,大规模搜索发现基因组 EST expressed sequence tag SNP SNP 及 ( ) 序列中的 已展开,应用于猪全基因组水平的 芯片已建立。在此基 SNP QTL quantitative trait loci 础上,基于猪 标记的遗传图谱绘制、 ( ) 定位、遗传多样性检测及全基因组关联 分析等也都相继出现。 SNP 关键词:猪; ;全基因组关联分析 Q959.842; Q78 中图分类号: 文献标识码:A Progresses of SNP in pig genome-wide studies 1 1 2 * CHEN Hui-Yong , LUO Sai-Qun , WU Zhen-Fang (1 Molecular Biology Research Center, College of Biological Science and Technology, Central South University, Changsha 410078, China; 2 Department of Animal Science, South China Agricultural University, Guangzhou 510640, China) Abstract: Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are abundant and widespread throughout the pig genome, occurring typically on average every 300-400 bps. About 557 k SNPs have been deposited in NCBIs SNP repository dbSNP. The pig whole genome is currently being sequenced with billions of

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