原发性肝癌高表达抗原GPC-3的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测.pdfVIP

· 26 · 解放军医药杂志 2013年8月 第 25卷 第 8期 Med＆PharmJChinPLA，Vo1．25，No．8，Aug．2013 · 论著 · 原发性肝癌高表达抗原 GPC一3的HLAA2限制性细胞毒性 T淋巴细胞表位预测 雷俊华，曾江正，郝新宝，苏群豪，洪 涛，何志惠，黄 芬 [摘要] 目的 预测原发性肝癌高表达抗原GPC-3的HLA—A2限制性细胞毒性 T淋 巴细胞 (CTL)表位 。方法 通过国家生物技术信息中心 (NCBI)数据库获取 GPC一3蛋 白的氨基酸序列 ，利用超基序 、量化基序法和 NetCTL数据库 预测分析 GPC一3的HLA．A2限制性 CTL表位 。结果 初步筛选出GPC一3肿瘤抗原的HLA—A2限制性 CTL优势表位 ， 分另0为 GPC-3102～110，155～163，169～177，229～237，281～289，319～327，326～334，367～375，522～530，564～ 572。结论 预测 出GPC一3的HLA—A2限制性 CTL表位为 GPC-3阳性原发性肝癌免疫靶 向治疗奠定了基础 。 [关键词] 原发性肝癌 ；磷脂酰肌醇蛋 白聚糖一3；表位 ；细胞毒性 T淋巴细胞 [中国图书资料分类号] R735．7 [文献标志码] A [文章编号] 2095—140X(2013)08-0026—03 [DoI] 10．3969／i．issn．2095—140X．2013．08．007 PredictionofHLA ·A2Restricted CytotoxicT LymphocyteEpitopein HighExpressionofTumorAntigen Glypi- can一3in PrimaryLiverCancer LEIJun—hua，ZENGJiang—zheng，HAOXin—bao，SUQun—hao，HONGTao，HEZhi—hui，HUANGFen(Departmentof MedicalOncology，AffiliatedHospitalofHainanMedicalCollege，Haikou570102，China) [Abstract] Objective TopredicttheHLA—A2restrictedcytotoxicTlymphocyte(CTL)epitopeinhighexpres— sionoftumorantigenglypican一3(GPC一3)inprimarylivercancer．Methods Theaminoacidsequencesoftumorantigen GPC一3wasobtainedfrom NationalCenterforBiotechnologyInformation(NCBI)database，andHLA—A2一restrictedglypi— can．3一derivedCTLepitopewerepredictedbyusingacombinationofthreecomputeralgorithmsofsuper—motif，quantita— tivemotifandNetCTLdatabasesmethods．Results ThepredominantHLA—A2restrictedCTL epitopespredictedinthe tumorantigenGPC一3were102—110，155—163，169—177，229—237，281—289，319—327，326—334，367—375，522—530and 564．572．Conclusion TheHLA—A2restrictedCTLepitopehasbeenpredictedintumorantigenGPC一3，which maybe usedofrfutureapplicationsinimmunotherapyoftargetedtherapyforprimallivercancerpatientswithpositivetumoranti— gen glypican一3． [Keywords] Primarylivercancer；Glypican一3；Epitope；CytotoxicTlymphocyte 目前资料表明，磷脂酰肌醇蛋 白聚糖一