MicroRNA相关单核苷酸多态性的原发性肝癌遗传易感性的研究.pdf

中文摘要 MicroRNA相关单核苷酸多态性与原发性肝癌遗传易感性 研究 中文摘要 原发性肝癌是世界范围内的常见恶性肿瘤之一，其发病原因不仅与环境暴 露因素有关，同时个体的遗传易感性也在其中起到了重要作用。近几年来，科 研人员发现了一种新的基因表达调控机制，即microRNA介导的转录后调控。该 调控机制的核心内容是microRNA种子区与相关基因mRNA上靶序列的 与靶基因的识别等方面，这种microRNA调控网络中发生的异常，最终能够影 响目的基因的表达和功能实现，从而改变个体的肿瘤易感性。在总结相关生物 信息学资料的基础上，结合中国人群特点，本研究选取了12个microRNA调控 网路中的SNPs，通过频数匹配的病例对照研究，采用聚合酶链反应．限制性片段 性位点进行检测，比较基因型频率在原发性肝癌患者和正常对照之间的分布差 异，探讨影响河南汉族人群原发性肝癌发病的基因型、单体型以及基因．环境交 互作用项，从而为原发性肝癌病因学研究和个体化防治提供思路。 目的 并推测其可能的作用机制。 rs2910164和 2．研究microRNA前体SNPs，具体包括pre．miR．146a rsl1614913位点及其与原发性肝癌遗传易感性的关联，并推测其 prc-miR．196a2 中文摘要 可能的作用机制。 基因rs3135500位点及其与原发性肝癌遗传易感性的关联，并推测其可能的作用 机制。 4．对上述SNPs进行部分和整体联合分析，探讨影响原发性肝癌发病的基因 型、单体型以及基因．环境交互作用。 方法 allele SNPs：r20．8，最小等位基因频率(minor frequency,MAF)设置为O．05。 rs3742330位点； 归入同一个单体型块。从DICERl基因中筛选出1个标签SNPs 从RAN基因中筛选出2个标签SNPs， GEMIN4基因中筛选出5个标签SNPs， rs2740348和rs3744741位点。 MicroRNA前体SNPs的选取：pre-miR．146a rsl 文献回顾，总结肝癌特征所涉及到的96个易感基因，然后在NCBI数据库中下 载96个基因3’非翻译区(3·untranslated PieTar、TargetSeans和RNAfold 和自由能，以与“种子”序列严格碱基互补配对的位点作为候选microRNA靶位 点，最终在这些基因里找到lO个SNPs存在于潜在的miRNA靶位点中，挑选与 肝癌关系密切，MAF0．05且结合自由能值(AAG)相对较大的2个位点进行实 采用频数匹配的病例对照研究方法选取河南汉族560例原发性肝癌患者和 560例正常对照，分别采用聚合酶链反应．限制性片段长度多态性(PCR．RFLP) 和等位基因特异PCR(AS．PCR)技术对上述12个多态性位点进行基因分型检 测。采用用，检验比较原发性肝癌患者和J下常对照组之间的一般人口学特征。 Ⅱ 中文摘要 采用非条件Logistic回归比较各基因型在原发性肝癌患者和正常对照之间分布 频率的差异。采用Haploview4．2软件进行单体型预测。采用7检验比较单体型 在两组分布的差异。采用趋势，检验分析突变位点数量与原发性肝癌发病风险 之『自J的剂量反应关系。采用多因素降维法(multifactor reduction， dimensionality MDR)和多因素Logistic回归分析基因-环境的交互作用。 牡甲 =日木 TT基因型携带者原发性肝癌的发 单位点分析结