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abeem模型铁卟啉分子的电荷分布
ABEEM模型下铁卟啉分子的电荷分布
ABEEM模型下铁卟啉分子的电荷分布
研究生:牛春莹
指导教师:杨忠志
专 业:物理化学
方 向:量子化学
中文摘要:
铁卟啉分子在生物体内起着十分重要的作用。人们熟知的进行氧传递作用的血红蛋
白、氧活化和电子传递的细胞色素C和细胞色素p-450都是金属铁卟啉系列。由于分子中
的电荷分布与分子的性质息息相关,计算铁卟啉化合物的电荷分布就显得非常重要。由
于传统的从头计算方法所需要的计算量太大,很难应用到大的分子体系。因此,发展准确
的、计算上易于实行的方法用于探讨大分子的性质是现在理论化学的重要任务。我们以密
度泛函理论“11和电负性均衡原理”11为基础,应用和开发了原子一键电负性均衡模型
(ABEEM)。利用最小二乘法拟合确定了一些分子的各种类型原子及化学键区域的参数。
运用这些参数,计算了有关铁卟啉分子的电荷分布以及分子的总能量,其得到的结果可以
和从头计算相媲美,并且计算所需要的时问与从头计算相比非常短。
关键词:铁卟啉分子血红素 密度泛函理论 电负性均衡原理 电荷分布
原子一键电负性均衡模型
1.综述
原子一键电负性均衡模型(ABEEM)是以密度泛函理论和电负性均衡原理为基础。
原子或分子之间的相互作用主要是由体系的电子密度决定的”…。获得电子密度随
分子构型和化学环境的变化而变化的信息非常重要。因此.处理化学体系的一个很吸引人
的近似就包括处理电子密度的变化。由于密度泛函理论(DFT)…“1直接将电子密度作为其
基本变量,因此它为处理这类问题提供了一个直接而且有力的工具。但由于在从头计算方
ABEEM模型下铁卟啉分子的电荷分布
法中,固有的计算量阻碍了其应用到非常大的分子体系。因而对于大分子体系,发展一种
计算量较小且有较高精度的近似方法就显得尤为重要。
处理这类问题的一类很有前途的方法是基于电负性均衡这个概念。Pauling最初定义
的电负性的概念为‘‘分子中的原子将电子拉向自身的能力””…。它已成为化学界应用最为
负性定义推广到密度泛函理论中,即原子的电负性Z是原子能量对电子数的导数的负值:
征
z一面。
密度泛函理论为许多直觉的化学概念诸如电负性“”、化学硬度…。”提供了严格的数学
定义,是电负性均衡原理的基础。电负性均衡原理的涵义是:当原子或分子相互作用达到
平衡时,它们的电负性必须相等。即,在分子的形成的过程中,分子中所有组成原子的电
负性最后达到相等。从密度泛函理论观点,这一结论可从对基态电子密度运用变分原理自
然得到…’。
1.1密度泛函理论(Density·Functional
Theory)
传统的从头计算或半经验的量子化学计算方法是由哈密顿算符n描述的电子体系,
能量总是波函数的泛函。用变分原理和自治场方法可求波函数和能量及体系的其它性质。
而密度泛函理论(DFT)是用简单的单电子密度pp)代替了复杂的N.电子波函数
甲(x。,x:,¨.,xⅣ)。将能量当作电子密度的泛函,用变分法和自治场方法求电子密度pp)
和体系的能量E[p]。
1.1.1
ltohenberg-Kohn定理
and
Honhenberg-Kohn Kohn
--定理(Honhenberg1964)指出,体系的单电子密度
户p)决定了体系的外势Vp),从而决定了体系的一切性质.体系的能量等都是pp)的泛
函,表示为e[p】。这时,体系的能量可表示为:
E,[p】=r【p】+■。[户]+K。【p】 (1.1】)
Honhenberg·Kohn第二定理实际上是密度泛函理论的变分原理。它的内容是:对于一个试
.2.
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