拓扑指数计算系及其应用.pdfVIP

摘要 在定量结构一性质／活性相关(QSPR／QSAR)研究中，分子结构的 数值化和建立良好预测的数学模型是两个重要的问题。分子结构 (2D／3D)数值化从不同的角度衍生了不同的分子结构表征描述子如 量子化学参数、电子参数、几何参数、拓扑指数，其中拓扑指数是计 算简便、适用范围较广的常用方法。迄今已有上百种拓扑指数被提出 并用于关联化合物的物化性质和生物活性。建立良好的预测数学模型 是进行QSAR／QSPR的最终目标，因而在模型中选择合适的变量和选择 合适的建模方法是重要的。 本文的主要内容和研究成果如下： 1．将分子的三维结构(以SDF、MOL等文件存储)，转化为二维 分子存储HQN编码，以此计算了分子连接性指数、Kappa形状指数、 电拓扑状态指数和分子电性距离矢量4类拓扑指数，并且基于此编写 了相应的拓扑指数计算系统TOPO．1。 2．提出了芳香性原子的识别算法，该算法减少了以往算法的盲 目性，使算法程序在运算速度和识别能力上有较大提高。该算法用于 了拓扑指数计算系统TOPO．1。 3．运用遗传算法、偏最小二乘和向后逐步回归变量选择方法， 从127个拓扑变量中选择7个建立了良好的拓扑指数与气相色谱保留 指数的相关关系模