劳亚兽总目系统育基因组学研究.pdfVIP

摘要 摘要 (Suprap血：【1ates)的姊妹群，并与后者合称北方兽类。目前的分子系统学研究认 但这六个目及目下各价元之间系统发育关系仍然模糊。系统发育基因组学 结合起来的一门学科。基于基因组大量的数据和性状，系统发育基因组学能够最 大避免基于线粒体及单个核基因数据系统发育分析引起的系统误差、生物学误差 以及节点支持率低等问题。本文主要是利用基于大量核基因的系统发育基因组学 研究方法探讨劳亚兽总目下六个目之间，以及鲸偶蹄目下高级价元以及海豚科内 部代表物种之间的系统发育关系。 利用本实验室新发展的97个核基因分子标记，在劳亚兽总目的13个代表物种 中进行扩增测序分析。合并数据及独立基因分析都强烈支持了真盲缺目独立地位 于劳亚兽的基部：支持鲸偶蹄目的单系发生；支持奇蹄目和鲸偶蹄目的姐妹群关 系，以及食肉目与鳞甲目的姐妹群关系。我们的结果并不支持Pe92Lsoferae组群 (奇蹄目+食肉目+鳞甲目+翼手目)的单系发生。同时基于目前已有劳亚兽的全 基因组数据搜索得到1608个外显子序列，系统发育分析结果同样支持上述部分结 论。”松散”分子钟分析结果指出包含食肉目、奇蹄目和鲸偶蹄目等的猛真有蹄类 (Fereu_ullgulata)在晚白垩纪(LateCretaceouS)可能经历过快速演化和不完全 的谱系分选。 15种，偶蹄目 基于我们测定的21种鲸偶蹄目代表物种(鲸目Cetacea 6种)的110个核基因分子标记序列分析，结果支持鲸目属于偶蹄目 从iodac谚la 亚目(Tylopoda)独立地位于鲸偶蹄目的基部。在现生鲸目中，结果强烈支持齿 支持了淡水豚类(river 海豚属(．妣咒e妇)的均为非单系性。联合化石标定的“松散”分子钟提示海豚科 摘要 Miocene)经历过快速演化。 (DelphiIlidae)在晚中新世(1ate 关键词：劳亚兽总目，鲸偶蹄目，系统发育基因组学，松散分子钟 ABSTRACT Abstract six Laumsiameria，including oneoft11efour ofextant Chiropter毛Pholidota，a11dEulipotyphla，waS m旬orgroups eutheriallm锄malsa11dwaSt11esister of of group iIlte卜aIldin仃a- ordinaJ witKnmis remainuncle狐 relationsllips superorder isanew wmchcombines aIld Phylogenomicsdiscipline genomicsphylogenetic on锄ourlt andcharacterSeom togemer．BaSedsequences demonstra_tesits and in di伍cult powergreatpotentialresolVing phylogenetic aIldin e11rors， relationshipsabstaj面ng仃omm柚yproblems，includingsystematic i11