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华东地区虎纹蛙个地理种群的遗传多样性与遗传结构研究.pdf
华东地区虎纹蛙三个地理种群的遗传多样性与遗传结构研究
摘 要
rugulosus)属于两栖纲无尾目叉舌蛙科虎纹蛙属物
虎纹蛙(Hoplobatrachus
种,广泛分布于中国南方地区。由于生境的片段化和丧失以及过度的人为捕杀,
其野外种群分布范围和数量都在急剧的缩小。本研究利用GenBank数据库和本
纹蛙地理种群(福建种群、安徽种群和江西种群)的遗传多样性和遗传结构。
研究结果表明:
1、7个微卫星座位均表现出较高的遗传多样性。在106个样品中共检测到
55个等位基因,各位点等位基因的数目在6至10个之间。每个基因座上的平均
等位基因为7.86个。所有位点的多态信息含量均大于O.5,平均PIC为0.825。
各位点观测杂合度和期望杂合度分别在在0.637.0.840和O.811-0.872之间,平均
观测杂合度和平均期望杂合度分别为O.739和0.849。
2、对所有位点进行哈迪温伯格平衡和连锁不平衡检测,结果显示有61.9%
的位点表现为显著或极显著的偏离哈迪温伯格平衡(氏0.01或P0.05),而各
位点间并未表现出明显的连锁不平衡现象。P值均大于O.05。
3、通过IAM、TPM或SMM三种突变模型对各种群瓶颈效应进行检测,结
果显示:江西、安徽和福建3个种群近期都经历种群瓶颈效应。
7
4、利用固定指数(风f)和Fishers确切性检验测定了三个种群间的遗传
分化程度,结果发现微卫星位点在各种群间并未发生明显的遗传分化,P值均大
于0.001。
5、根据Nei台无偏差遗传距离和构建的UPGMA聚类图显示,安徽和江西种
群的遗传距离最近,为O.1146,安徽和福建种群的遗传距离最远,为O.1437。
6、对三个种群基因流的研究显示:%值均大于1,各地理种群间的基因流
较高。同时各地理种群的R正值较多,说明在各种群内部的个体间存在着广泛
的近交现象。
关键词:虎纹蛙:微卫星;遗传多样性;瓶颈效应;种群遗传结构;基因流
T
Genetic and Structureofthe
Diversity
Population TigerFrog
three ineastareaof
(HoplobatrachusruguIosus)ofpopulations
China.
ABSTRACT
The distributedinSouthChina.
TigerFrog(Hoplobatrachusrugulosus)is
widely
Becauseofthe
habitat and excessive
human
fTagrnentationdestroying,also hunting,
the anddistributionthe
population of has this
speciesshrinkingsharply.In
study,we
choose7species-specific which
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