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水稻亲本资源的传多样性分析及指纹图谱构建.pdf
摘要
水稻是世界上主要的粮食作物之一,是世界上大多数人口的主要
食粮。在中国,随着杂交水稻的大面积推广及超级稻的成功应用,水
稻产量得到大幅度提高,因此,研究水稻的遗传多样性,弄清水稻品
种间亲缘关系,为杂交水稻高产优质抗病育种提供优良中间材料就显
得尤为重要。本文利用48对SSR引物对湖南未名凯拓公司种质资源
库所提供的368份水稻亲本资源进行遗传多样性分析,主要结果如
下:
48对引物共检测出181个多态性位点,平均每个引物检测出3.77
个等位基因,籼稻中平均为3.77个,粳稻平均为3.60个,籼稻和粳
稻的遗传多样性指数分别为0.7104和0.5887,根据单个位点的等位
基因数和平均基因多样性可以说明亲本资源中籼稻的遗传多样性要
大于粳稻。
另外从三个角度进行遗传多样性分析,分别是不同亚种(籼粳)
及不同地理来源(省市),聚类分析结果表明,所有的供试材料可以
很好的分为两类,籼亚种和粳亚种,与亲本亲缘关系基本一致。除了
利用SSR标记,利用室内考种数据和田间农艺性状进行的聚类分析
结果表明,由于农艺性状是不仅受到基因表达的作用,还会因为外界
条件而进行改变,对品种间遗传结构的揭示能力有限。
随后对部分亲本资源(不育系,保持系以及恢复系)进行了SSR
聚类分析,从结果中可以看出,两系不育系基本上聚为一类,这也表
明两系不育系的遗传差异较小,与两系不育系一样,三系不育系也聚
为一类,遗传差异较/ix;整体上来看,不育系和恢复系较好的分为两
类,保持系基本上被分在了几个类中,聚类结果也与所得到的遗传多
样性指数的结果一致。对部分亲本资源的聚类分析表明,恢复系和不
育系之间的遗传距离相对来说较远,间接的反映了杂种优势与遗传距
离的正相关关系,为水稻育种提供了一定的科学指导依据。
根据SSR的结果,从48对引物中筛选出扩增稳定、多态性丰富、
条带清晰的24对引物作为构建指纹图谱的引物(每条染色体上分布
两条),其中12对为核心引物,另12对为候选引物,作为核心引物
的补充,有助于今后公司水稻育种知识产权的保护及对水稻种质资源
进行鉴定,不过未设计杂种实验,利用指纹图谱进行种质分析还需进
一步检验其可靠性。
关键词:亲本资源,遗传多样性,分子标记,聚类分析
ABSTRACT
oneofthemost and
Rice(Oryzasativa)is important
cropsmajor
foodfor intheworld.In ofricehave
China,the
manypeople yields
increasedsincethe of riceandresearchfor
greatly applicationhybrid
itis to the diversitiesand
super-rice.Soveryimportantstudygenetic
relations the ofthericewhichhas themain
amongparents provided
materials
forricebreeders.
The ofmorethan360 rice of
geneticdiversity hybridpro-sources
Hunan was
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